陪产假期间，员工的全勤奖通常不应被扣除，且工资应按正常标准发放。以下是对此问题的详细分析：
一、陪产假的法律性质与工资发放原则
陪产假是男性员工在配偶生育期间享有的法定假期，其性质属于带薪休假。根据《工资支付暂行规定》以及各地的人口与计划生育条例等地方性法规，陪产假期间员工应视为正常出勤，用人单位需按照其正常工作时间的工资标准支付工资。这包括基本工资、岗位工资、津贴、补贴等固定部分，但不包含加班工资等特殊情况下支付的工资。
二、全勤奖与陪产假的关系
全勤奖是用人单位为了鼓励员工全勤工作而设立的一种奖励制度。然而，陪产假是员工的法定权利，其享受陪产假期间并未违反用人单位的规章制度或劳动合同约定。因此，从法律角度来看，用人单位不应因员工享受陪产假而扣除其全勤奖。
三、特殊情况处理
用人单位规章制度：虽然陪产假期间员工应视为正常出勤，但如果用人单位的规章制度中明确规定了全勤奖的发放条件，且该条件与陪产假相冲突（例如，规定全勤奖仅发放给当月无任何缺勤的员工），那么员工可能无法获得全勤奖。但这种情况较为少见，且用人单位的规章制度需符合法律法规的规定，不得损害员工的合法权益。
协商与沟通：如果员工对全勤奖的扣除有异议，建议首先与用人单位进行协商和沟通。通过友好协商，双方可以达成共识，解决争议。
法律途径：如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉举报，或者申请劳动仲裁、提起诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。
四、用人单位的责任与义务
用人单位应严格遵守相关法律法规，支持员工申请陪产假，并按照规定发放陪产假期间的工资和福利待遇。克扣或拖欠陪产假工资、全勤奖等行为将受到法律制裁，员工有权向相关部门投诉并寻求法律援助。
五、建议与总结
了解当地规定：员工应了解当地关于陪产假的具体规定，包括假期天数、工资发放标准等，以确保自身权益得到充分保障。
保留证据：在享受陪产假期间，员工应保留好相关证据，如请假条、工资条等，以备不时之需。
及时沟通：如果员工对全勤奖的扣除有异议，应及时与用人单位进行沟通，寻求解决方案。
综上所述，陪产假期间员工的全勤奖通常不应被扣除。如果用人单位违反规定扣除全勤奖或工资，员工有权通过法律途径来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。