关于公司要求停薪留职时工资的计算问题，这通常涉及到劳动合同、公司规章制度以及相关法律法规的综合考量。以下是我为您详细梳理的解答：
一、工资计算的基础依据
劳动合同约定：
- 首先，应查看劳动合同中是否有关于停薪留职期间工资待遇的明确约定。如果有，那么应严格按照合同约定来执行。
公司规章制度：
- 如果劳动合同中没有明确规定，那么需要查看公司的规章制度。公司内部可能制定了关于停薪留职的具体规定，这些规定也是工资计算的重要依据。
法律法规：
- 在没有劳动合同约定或公司规章制度明确规定的情况下，应参照国家相关法律法规来确定工资标准。特别是《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，对员工的工资待遇有明确的保护规定。
二、具体计算方法
按原工资标准支付（若适用停工留薪情形）：
- 如果停薪留职实际上是指停工留薪（如因工伤等原因），那么根据相关规定，员工在停工留薪期内，原工资福利待遇应保持不变，并由所在单位按月支付。这包括基本工资、奖金、津贴等固定和浮动部分（但需注意，某些与出勤和业绩直接挂钩的浮动部分可能根据公司规定有所调整）。
- 具体计算时，若员工工作满12个月，则以工伤前12个月的月平均工资为基数；若工作不满12个月，则按照实际工作月数的月平均工资计算。
协商确定或参照最低工资标准（若非停工留薪情形）：
- 如果停薪留职并非因工伤等原因，而是双方协商的结果或其他特殊情况，那么工资标准可能通过协商确定。
- 在没有协商或协商不成的情况下，应确保员工的工资不低于当地最低工资标准，以保障员工的基本生活需求。
扣除部分项目的考虑：
- 无论是哪种情况，如果公司规定某些工资项目（如绩效工资、奖金等）与出勤或业绩直接挂钩，且员工在停薪留职期间未提供实际劳动或未达到业绩标准，那么这些项目可能会根据公司规定进行相应调整或不予发放。
三、特殊情况处理
协商一致：
- 用人单位与员工可以就停薪留职期间的工资标准进行协商，并达成一致意见。这种情况下，双方应签订书面协议，明确工资标准和支付方式，以避免后续纠纷。
违法违规情形的处理：
- 如果用人单位无故降低或克扣员工在停薪留职期间的工资，可能构成违法行为。员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
四、示例说明
假设某员工的正常月工资为5000元，其中基本工资3000元，绩效工资1500元（与月度工作成果挂钩），津贴500元（与出勤情况有关）。如果该员工因工伤被停工留薪一个月，且公司规定停工留薪期间原工资福利待遇不变，则该员工当月的工资仍应为5000元。但如果该员工是因其他原因被停薪留职，且公司规定停薪留职期间不享受绩效工资和津贴，则该员工当月的工资可能仅为3000元（即基本工资部分），但需确保不低于当地最低工资标准。
综上所述，停薪留职期间工资的计算是一个综合考虑多种因素的过程。建议您在具体操作时，先查看劳动合同和公司规章制度，再结合相关法律法规进行综合判断。如有必要，可咨询专业律师或劳动监察部门以获取更准确的指导。