针对您提出的“宅基地合法超出规定面积怎么处理”的问题，这是一个涉及法律法规和地方政策的具体问题，需要综合考虑多方面因素来给出合理的解答。以下是我为您详细梳理的处理方式和建议：
一、法律法规基础
首先，我们要明确的是，宅基地的管理主要依据《中华人民共和国土地管理法》以及相关的村镇建房用地管理条例。这些法律法规明确了宅基地的使用标准、非法占用的法律责任等，为处理宅基地超出规定面积的问题提供了基本法律依据。
二、常见处理方式
历史遗留问题处理：
- 对于因历史原因造成的宅基地超标，如早期管理不规范导致的超占，一般可根据当时政策进行确权登记，但会在登记簿和权属证书附记栏中明确注明超出标准的面积。
- 当宅基地进行翻建、改建、扩建或重新建设时，必须严格按照当地规定的标准执行，超出部分不予确权。
新申请宅基地超标处理：
- 如果新申请的宅基地面积超出标准，通常在审批环节就不会通过。农户需要重新调整申请面积，符合标准后才可能获得批准。
- 若未经批准擅自超面积建设，属于违规行为。相关部门有权责令限期整改，可能要求拆除超出标准部分的建筑，或处以罚款等处罚措施。
继承房屋导致的宅基地超标处理：
- 因继承房屋而导致宅基地实际使用面积超过标准的，在房屋存续期间，一般可以维持现状继续使用。
- 但当继承的房屋灭失后，不能再重建，宅基地应由村集体收回，并按照规定重新分配使用。
其他灵活处理方式：
- 宅田相抵政策：通过减少相应面积的耕地来平衡超出的宅基地面积，确保土地资源合理利用。
- 缴费补偿方式：村民与村集体协商，缴纳一定费用以保留超出的宅基地部分，并报上级部门批准。
- 村民自治协商原则：村集体成员共同商定处理方案，上报审批，尊重村民意愿和自治权利。
三、重要提示与建议
咨询当地政策：
- 宅基地超占面积的处理方式可能因地区而异，建议农户及时咨询当地的土地管理部门或专业律师，了解具体的法律法规和政策要求。
遵守法律法规：
- 农户应严格遵守相关法律法规和规定，避免因不当行为而引发不必要的法律纠纷和经济损失。
及时办理手续：
- 对于历史遗留问题或特殊情况下的宅基地超标，应尽快补办相关手续或缴纳相应费用，以合法化超出的面积。
加强宅基地管理：
- 村集体和相关部门应加强宅基地的管理和监督，完善相关政策和法规，预防未来超占现象的发生。
综上所述，处理宅基地超出规定面积的问题需要综合考虑历史背景、原因、现状以及当地政策法规等多方面因素。农户应积极配合政府部门的监管工作，确保宅基地的使用符合法律法规的要求。同时，也建议农户在面临此类问题时及时咨询专业人士或相关部门以获取更具体、更准确的指导。