关于您提出的“请假两周后申请离职可以吗”的问题，这主要涉及到两个方面的法律规定：一是请假制度，二是离职通知期限。
首先，关于请假制度，劳动者因患病或非因工负伤，确实有权根据医疗机构出具的病假证明向用人单位申请病休。但这一权利的行使应当受到相应的约束，比如需要提供真实的病假证明，遵守用人单位的请假流程，以及在病假期间保持与用人单位的沟通等。如果您已经按照公司规定办理了请假手续，并且获得了批准，那么请假两周本身是没有问题的。
接下来，关于离职通知期限，根据《劳动合同法》第三十七条的规定，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。如果您在试用期内，则只需提前三日通知。这意味着，如果您打算在请假两周后离职，您需要确保在离职前至少提前三十日（或试用期内提前三日）以书面形式通知用人单位。
现在，结合您的情况来看，如果您已经请假两周，并且打算在这两周结束后离职，那么您需要：
确认请假是否已获批准：确保您的请假申请已经得到了用人单位的正式批准，并且您已经按照公司规定提供了必要的病假证明。
提前通知离职：在请假结束前，您需要以书面形式向用人单位提出离职申请，并明确告知离职日期。这个离职日期应当至少在您提出离职申请后的三十日（或试用期内提前三日）之后。
办理离职手续：在离职日期到来时，按照用人单位的要求办理离职手续，包括工作交接、工资结算等。
遵守职业道德和劳动纪律：在离职过程中，您应当继续遵守用人单位的劳动纪律和职业道德，不得损害用人单位的利益。
最后，需要提醒的是，如果您在请假期间存在弄虚作假、隐瞒病情等行为，或者未按照公司规定办理请假和离职手续，用人单位有权根据相关法律法规和公司规章制度对您进行处理，甚至可能解除劳动合同而不支付经济补偿。
因此，我建议您在请假和离职过程中务必遵守相关法律法规和公司规章制度，确保自己的权益得到保障的同时，也维护好与用人单位的良好关系。