擅自改变机动车已登记的结构、构造或者特征是违法行为，将面临罚款、责令恢复原状、扣留车辆等处罚，且可能影响车辆年检和保险理赔。以下是对此问题的详细分析：

一、法律定义与禁止性规定

根据《中华人民共和国道路交通安全法》第十六条的规定，任何单位或者个人不得拼装机动车或者擅自改变机动车已登记的结构、构造或者特征。这一法条明确禁止了擅自改变机动车结构、构造或特征的行为，旨在维护道路交通安全和车辆管理秩序。

二、非法改装的界定

非法改装指的是未经公安机关交通管理部门允许，擅自对机动车已登记的结构、构造或特征进行改动。这包括但不限于以下行为：

1. 改变车身颜色：未按规定备案即改变车身颜色。
2. 更换重要部件：如更换发动机、车架等，未经车辆管理所变更登记。
3. 改变车辆结构：如增加或减少座椅数量，改变车辆核定的载客人数；改装悬挂系统，提升或降低车身高度等。

三、法律责任与处罚

对于擅自改变机动车结构、构造或特征的行为，公安机关交通管理部门将依法进行处罚，具体包括：

1. 罚款：根据相关法规，擅自改变机动车结构、构造的，将面临警告或罚款，一般处以200元至500元不等，具体金额各地有所差异。
2. 责令恢复原状：公安机关交通管理部门会责令车主将车辆恢复到原登记状态，以确保车辆符合原登记的技术数据和安全要求。
3. 扣留车辆：如果驾驶非法改装的机动车上路，公安交管部门有权扣留车辆，收缴非法装置，并依法处罚。
4. 影响年检：非法改装还可能影响车辆的年检，必须通过恢复原状并重新检验后才能通过。
5. 保险理赔风险：在发生交通事故时，如果车辆存在擅自改变结构、构造的情况，保险公司可能会拒绝理赔。

四、合法改装指引

若因特殊需求确需改变机动车结构、构造，应当按照以下步骤进行：

1. 提出申请：向车辆登记地的车辆管理所提出变更登记申请。
2. 获得批准：等待车辆管理所的批准，获得改装许可。
3. 完成改装：按照批准的内容和要求完成改装。
4. 办理变更手续：改装完成后，及时到车辆管理所办理变更手续，更新车辆登记信息。

五、实际应用中的指导意义

作为驾驶人或车主，应当严格遵守相关法律法规，不得擅自对机动车进行非法改装。合法的改装不仅能够确保车辆的安全性和合法性，还能避免不必要的法律风险和经济损失。同时，公安机关交通管理部门也应加强监管力度，对非法改装行为进行严厉打击，以保障道路交通安全和秩序。

总结来说，擅自改变机动车已登记的结构、构造或者特征是严重的违法行为，不仅会对道路交通安全构成威胁，还会给车主带来诸多法律和经济上的麻烦。因此，务必遵守相关规定，确保机动车的合法性和安全性。如果你对车辆改装有任何疑问或需求，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。