工伤鉴定仅鉴定小肠切除长度而不考虑功能障碍是不合法的。以下从多个角度进行分析：

1. 工伤鉴定的全面性原则：

   • 工伤鉴定是一个综合评估的过程，它不仅仅关注单一的身体损伤指标，如小肠切除的长度，而是需要全面考虑工伤对劳动者身体功能、生活自理能力以及工作能力等多方面的影响。功能障碍是工伤鉴定中不可或缺的一部分，它直接关系到劳动者工伤后的生活质量和劳动能力恢复情况。

2. 相关法律法规的规定：

   • 根据《工伤保险条例》及相关规定，工伤鉴定应当依据劳动者的实际伤情，包括身体损伤和功能障碍，进行综合评定。这意味着，在工伤鉴定过程中，必须充分考虑劳动者的功能障碍情况，而不能仅依据某一单一指标进行判定。

3. 功能障碍对工伤赔偿的影响：

   • 功能障碍是确定工伤赔偿等级和赔偿金额的重要因素之一。如果工伤鉴定仅考虑小肠切除长度而忽略功能障碍，那么可能导致劳动者的工伤赔偿等级被低估，进而影响其应得的赔偿金额。这不仅损害了劳动者的合法权益，也违背了工伤保险制度的初衷。

4. 实际操作中的建议：

   • 在进行工伤鉴定时，劳动者应积极提供与功能障碍相关的医疗证明和资料，如病历、诊断证明、康复评估报告等，以便鉴定机构能够全面了解其伤情和功能障碍情况。
   • 如果劳动者认为工伤鉴定结果存在不公或遗漏，可以依法申请重新鉴定或提出异议，以维护自己的合法权益。

总结与建议：工伤鉴定是一个复杂而细致的过程，它要求鉴定机构全面、客观地评估劳动者的伤情和功能障碍情况。因此，仅鉴定小肠切除长度而不考虑功能障碍是不合法的。劳动者在进行工伤鉴定时，应充分了解自己的权益和鉴定流程，积极提供相关证据和资料，以确保鉴定结果的公正性和准确性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。