醉驾案件的起诉工作主要由检察机关，即人民检察院负责。以下是对这一问题的详细解析：
一、起诉主体与流程
公安机关交通管理部门初步调查：醉驾案件发生后，公安机关交通管理部门会首先介入，进行初步的调查取证工作，包括现场勘查、对涉嫌醉驾的驾驶员进行酒精检测等，以收集初步证据。
公安机关侦查：若初步调查显示存在醉驾行为，公安机关交通管理部门会将案件移送至公安机关进行进一步侦查。公安机关会深入调查取证，形成完整的证据链条。
案件移送检察机关：公安机关侦查终结后，会将案件及相关证据材料移送至有管辖权的检察机关，即人民检察院。
检察机关审查起诉：人民检察院接收到案件后，会对案件进行全面细致的审查。这包括核对证据的真实性、充分性，判断犯罪事实是否清晰明了，以及适用法律是否正确等。若认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，人民检察院会向法院提起公诉。
二、特殊情况说明
虽然醉驾案件通常由检察机关起诉，但在某些特殊情况下，人民检察院可能会作出不起诉决定。这些特殊情况包括：
犯罪情节显著轻微、危害不大：若醉驾情节较轻，如初次醉驾且未造成实际危害后果，或者血液中的酒精含量刚刚超过醉驾标准、行驶距离较短、行驶速度较慢等，综合考虑各种因素后，检察院可能会认为情节显著轻微、危害不大，从而作出不起诉决定。
犯罪已过追诉时效期限：根据《刑法》规定，危险驾驶罪的法定最高刑为拘役，追诉时效为五年。若醉驾行为发生时间距离发现时已经超过了五年，检察院可能会因犯罪已过追诉时效期限而作出不起诉决定。
经特赦令免除刑罚：虽然罕见，但如果醉驾者符合特赦令的条件，经特赦令免除刑罚，检察院将不会对其提起起诉。
犯罪嫌疑人、被告人死亡：一旦犯罪嫌疑人、被告人死亡，刑事诉讼程序即无法继续进行，检察院会作出不起诉决定。
三、法律后果与建议
醉驾行为是极其危险和违法的，不仅可能面临严厉的刑事处罚（如拘役、罚金等）、行政处罚（如吊销机动车驾驶证、五年内不得重新取得等），还可能对个人声誉和家庭造成不可挽回的影响。因此，我强烈建议广大驾驶员要严格遵守交通法规，切勿酒后驾车。
若您或您身边的人不幸涉及醉驾案件，请及时向我咨询，我会根据案件的具体情况和相关法律规定，为您提供专业的法律建议和帮助。