在农业用地上建房子，一般情况下是不合法的，因为这违反了我国严格的土地用途管制和耕地保护制度。不过，也存在一些特殊情况，使得在农业用地上建房变得合法。以下是对这一问题的详细分析：
一、不合法的依据与分析
土地用途管制与耕地保护：
- 我国实行严格的土地用途管制制度和耕地保护制度，耕地主要用于农业生产，以确保国家的粮食安全和农业可持续发展。
- 《土地管理法》明确规定，禁止占用耕地进行非农业建设，如建窑、建坟、建房等。未经批准擅自改变耕地用途是违法的。
法律后果：
- 非法占用耕地建房将受到法律的制裁。县级以上人民政府自然资源主管部门有权责令退还非法占用的土地，并限期拆除在非法占用的土地上新建的房屋。
- 此类违法建筑可能面临被拆除的风险，且拆除费用通常由违法者承担。此外，还可能面临罚款等行政处罚。
对土地和资源的影响：
- 擅自在耕地上建房会破坏耕地的原有功能，导致土壤质量下降、生态环境破坏以及粮食生产能力的降低。
二、特殊合法情况
尽管一般情况下在农业用地上建房是不合法的，但也存在一些特殊情况，使得这种行为变得合法：
国家重点建设项目：
- 在特定情况下，如因国家能源、交通、水利、军事设施等重点建设项目选址确实难以避让永久基本农田，涉及农用地转用或者土地征收的，必须经国务院批准后方可实施。这种情况下，在农业用地上建房是合法的。
合法的审批程序：
- 农村村民在符合宅基地申请条件的前提下，可以通过一系列法定程序将耕地依法转为建设用地后再建房。
- 这包括经过本集体经济组织同意、乡（镇）人民政府审核、县级人民政府批准等步骤，并办理农用地转用审批手续。只有获得相关政府部门的批准和许可后，才能进行房屋建设活动。
遵守规划要求：
- 即使在农村地区，也存在特定的土地利用规划和村庄规划。村民在建造住宅时，应当遵守这些规划，并依法申请宅基地使用权。如果规划允许在特定农业用地上建房，且符合相关审批程序，那么这种行为也是合法的。
三、建议与风险提示
- 咨询当地土地管理部门：在打算在农业用地上建房之前，务必咨询当地的土地管理部门或专业律师，了解相关的法律法规和政策要求。
- 确保合法审批：如果确实需要在农业用地上建房，必须依法经过严格的审批程序，获得相关政府部门的批准和许可。
- 避免法律风险：未经批准擅自在农业用地上建房是违法的，可能面临严重的法律后果。因此，务必确保自己的行为符合法律规定，避免不必要的法律风险和经济损失。
总结来说，在农业用地上建房一般情况下是不合法的，但存在一些特殊情况使得这种行为变得合法。为了确保自己的权益和避免法律风险，建议在打算建房之前充分了解相关法律法规和政策要求，并依法经过严格的审批程序。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。