针对您提出的问题，即离婚协议中房子归男方，但女方不配合签字过户且已过起诉期限的情况，以下是我为您提供的详细解答：

一、核心建议

尽管可能已过一般的起诉期限，但您仍应首先尝试与女方进行友好沟通，明确表达过户的意愿及法律义务。若沟通无果，您可考虑通过法律途径，特别是申请强制执行（如果离婚协议已经过法院司法确认或存在相关判决），来维护自己的合法权益。

二、详细步骤与措施

1. 友好沟通与协商：

   • 主动与女方取得联系，以平和的态度说明过户的紧迫性和必要性。
   • 强调离婚协议中的明确约定，以及女方配合过户的法律义务。
   • 尝试了解女方不配合的具体原因，看是否能够通过协商找到双方都能接受的解决方案。

2. 寻求第三方调解：

   • 如果直接沟通未能取得进展，可以考虑邀请亲友、婚姻登记部门或人民调解委员会等第三方机构介入调解。
   • 第三方调解往往能提供更中立的视角，有助于双方达成共识。

3. 法律途径：

   • 书面通知：在采取法律行动前，向女方发出正式书面通知，明确要求其限期配合办理过户手续，并保留好通知的发送凭证。
   • 申请强制执行（如果适用）：
     • 如果离婚协议已经过法院司法确认，或者您之前已经就过户问题提起过诉讼并获得了法院判决，但女方仍未履行，那么您可以向法院申请强制执行。
     • 提交申请时，需提供离婚协议、法院判决书或司法确认书等相关证据材料。
     • 法院在受理申请后，会发出执行通知，要求女方配合过户。如果女方拒不执行，法院有权采取查封、拍卖等强制措施。
   • 重新提起诉讼（如果未过特殊时效或存在其他情况）：
     • 一般情况下，如果已过起诉期限，重新提起诉讼可能面临困难。但如果您能证明存在特殊情况（如女方存在欺诈、胁迫等行为，或者您之前因不可抗力等原因无法提起诉讼），则可能有机会重新获得法院的受理。
     • 在此情况下，建议咨询专业律师，评估重新提起诉讼的可行性和风险。

4. 注意事项：

   • 留存证据：在整个过程中，务必妥善保存所有与沟通、调解、法律行动相关的证据材料，以备后续使用。
   • 协议有效性：确保离婚协议内容真实、合法，且未违反法律法规的强制性规定。如果协议存在瑕疵或无效条款，可能会影响您的法律权益。
   • 咨询专业律师：由于法律问题具有复杂性和专业性，建议您在采取任何法律行动前咨询专业律师，以获取更具体、更准确的法律建议。

三、总结与展望

面对女方不配合办理房产过户的情况，您应首先尝试通过友好沟通和调解解决问题。如果协商无果，且离婚协议已经过法院司法确认或存在相关判决，您可以考虑申请强制执行来维护自己的合法权益。在整个过程中，注意留存证据、确保协议的有效性，并咨询专业律师以获取更全面的法律支持。希望这些建议能对您有所帮助，并祝您早日解决这一问题。