股东死亡后，其股权由儿子继承，需要办理以下证明及手续：

1. 死亡证明：首先，需要提供股东的死亡证明文件，这是确认股东身份终止及启动继承程序的基础。死亡证明通常由医院、公安机关或法院出具，证明股东已经去世。

2. 继承权证明：

   • 遗嘱（如有）：如果股东生前立有遗嘱，并明确指定了股权由儿子继承，那么需要提供这份遗嘱作为继承权的直接证据。遗嘱应当符合法律规定的形式要件，如自书遗嘱需由遗嘱人亲笔书写、签名并注明年、月、日；代书遗嘱、录音遗嘱或口头遗嘱则需有两个以上无利害关系的见证人在场见证。
   • 法定继承证明：若无遗嘱或遗嘱无效，则按照法定继承顺序进行。在此情况下，需要提供能够证明儿子是法定继承人的文件，如户口簿、出生证明、亲属关系证明等，以证明儿子与死亡股东之间的父子关系，从而确立其继承权。

3. 股权变更登记申请：在取得继承权证明后，儿子（作为新股东）需要向公司提交股权变更登记申请。这一申请通常包括填写股权变更登记表、提供继承权证明文件、死亡证明以及新股东的身份证明等材料。

4. 公司内部程序：根据公司的章程或相关法律法规，可能还需要经过公司股东会或董事会的决议，同意股权的变更。这一步骤的具体要求因公司而异，有的公司可能要求所有股东签字同意，有的则可能只需达到一定比例的股东同意即可。

5. 工商变更登记：最后，需要携带上述所有文件到工商行政管理部门办理股权变更登记手续。工商部门在审核材料无误后，会更新公司的股东名册，并颁发新的营业执照或进行其他必要的登记变更。

额外建议：

• 在整个继承过程中，建议保持与公司的良好沟通，确保所有步骤都符合公司的规定和法律法规的要求。
• 如果涉及复杂的继承关系或公司结构，考虑咨询专业的法律人士或会计师，以确保继承过程的顺利进行和股权变更的合法有效。
• 继承过程中可能涉及税费问题，如遗产税（如当地有开征）或个人所得税等，也需提前了解并做好相应准备。