协议手写两份且各自持有一份，在符合法定条件的情况下是有效的。以下从不同角度为你详细分析：

协议有效的法定条件

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，一份有效的协议（合同）通常需要满足以下几个基本条件：

1. 行为人具有相应的民事行为能力：这意味着签订协议的双方（或多方）必须具备能够理解协议内容并承担相应法律责任的能力。例如，未成年人或精神病人可能因缺乏相应的民事行为能力而无法独立签订有效的协议。
2. 意思表示真实：协议的内容必须是双方真实意愿的体现，不存在欺诈、胁迫或乘人之危等情形。如果一方在签订协议时受到了不正当的影响，导致其意思表示不真实，那么该协议可能被视为无效或可撤销。
3. 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：协议的内容必须合法，不得违反国家法律法规的强制性规定，也不得违背社会公德和公共秩序。例如，一份涉及非法交易或侵犯他人权益的协议将是无效的。

手写协议的特殊性

手写协议与打印协议在法律效力上并无本质区别，只要满足上述法定条件，手写协议同样具有法律效力。然而，手写协议可能存在一些特殊问题需要注意：

1. 字迹清晰度：手写协议的字迹必须清晰可辨，否则可能因无法识别内容而导致协议无效或产生争议。
2. 修改与涂改：如果手写协议在签订后进行了修改或涂改，必须确保这些修改或涂改是双方共同认可的，并且最好在修改或涂改处签字或盖章以确认。否则，修改或涂改部分可能被视为无效或产生争议。

各自持有一份的影响

双方各自持有一份协议，这实际上是协议签订过程中的一种常见做法，有助于确保双方都能保留一份完整的协议副本作为证据。只要两份协议的内容完全一致，并且都满足了上述法定条件，那么这两份协议都是有效的，并且具有同等的法律效力。

实际操作建议

1. 确保协议内容完整、明确：在签订手写协议时，务必确保协议内容完整、明确，避免出现模糊或歧义的条款。
2. 双方签字或盖章：协议必须由双方签字或盖章以确认其真实性和有效性。如果可能的话，最好在签字或盖章处注明日期。
3. 保留好协议副本：双方应各自保留一份完整的协议副本，并妥善保管以备不时之需。

如果你在签订或执行手写协议过程中遇到任何问题或争议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。