结论：仅凭聊天记录，一般不能直接申请调查令起诉“小三”，但聊天记录可以作为证据之一，在符合一定条件下，辅助证明相关事实，进而支持起诉。
分析说明：
聊天记录作为证据的效力：
- 聊天记录属于电子数据的一种，根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，电子数据是可以作为证据使用的。但聊天记录要作为有效证据，必须满足真实性、合法性和关联性的要求。真实性指的是聊天记录确实是双方交流的真实记录，没有被篡改或伪造；合法性指的是聊天记录的获取方式必须合法，不能通过非法手段获取；关联性则指的是聊天记录与案件事实有直接的联系，能够证明相关事实。
申请调查令的条件：
- 调查令通常是在诉讼过程中，由法院根据当事人的申请，向有关单位或个人发出的，要求其协助调查特定事项的命令。申请调查令需要满足一定的条件，如申请人必须是诉讼当事人或其诉讼代理人，且需要提供充分的理由说明为何需要调查该事项，以及该事项与案件事实的关联性等。仅凭聊天记录，通常不足以直接申请调查令，因为聊天记录本身可能无法直接证明所有需要证明的事实，还需要其他证据进行佐证。
起诉“小三”的法律依据及证据要求：
- 如果起诉“小三”涉及的是侵犯名誉权、隐私权等民事权益，或者涉及的是重婚等刑事犯罪，那么需要依据相应的法律法规进行起诉。在这些情况下，聊天记录可以作为证据之一，但通常还需要其他证据如证人证言、物证、视听资料等来共同证明相关事实。特别是如果涉及重婚等刑事犯罪，还需要有更确凿的证据来证明“小三”与已婚者之间存在长期稳定的同居关系等。
特殊场景：
- 如果聊天记录中明确显示了“小三”与已婚者之间的不正当关系，且该聊天记录与其他证据（如证人证言、转账记录等）相互印证，形成了完整的证据链，那么在这种情况下，聊天记录可能成为支持起诉的关键证据之一。但即便如此，也需要根据具体情况来判断是否需要申请调查令来进一步调查相关事实。
行动建议：
- 如果你打算起诉“小三”，建议先收集尽可能多的证据，包括聊天记录、证人证言、物证、视听资料等，以形成完整的证据链。
- 在收集证据的过程中，要注意证据的合法性、真实性和关联性，避免使用非法手段获取证据。
- 如果认为需要申请调查令来进一步调查相关事实，建议咨询专业律师，了解申请调查令的具体条件和程序，并根据律师的建议进行操作。
法律后果：
- 如果起诉“小三”成功，且“小三”的行为确实构成了侵权或犯罪，那么“小三”可能需要承担相应的民事责任或刑事责任。但具体责任的大小和性质，需要根据案件的具体情况和相关法律法规来判断。
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