结论前置：民间协议只签字没按指印，在一般情况下是有效的，具有法律效力。但具体效力还需根据协议的具体条款、当事人的真实意思表示以及相关法律规定来综合判断。
法律依据与分析
法律基础：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百四十三条，民事法律行为有效的条件包括：行为人具有相应的民事行为能力；意思表示真实；不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。这意味着，只要协议满足这些条件，即使没有按指印，也是有效的。
- 《民法典》第四百九十条进一步规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这表明签字、盖章和按指印都是合同成立的合法方式，且它们之间具有同等的法律效力。
签字与按指印的法律效力：
- 签字：签字是当事人对协议内容的确认，体现了其真实的意思表示。只要签字是真实的，且符合合同签订的相关规定，协议即被视为有效。
- 按指印：按指印主要作为增强协议真实性和可信度的辅助手段，与签字具有同等法律效力，但并非协议生效的必要条件。如果协议中未明确约定必须同时签字并按指印才生效，则仅签字即可视为协议有效。
具体情况分析：
- 无特殊约定：若协议中未明确约定必须同时签字并按指印才生效，那么只签字没按指印的协议是有效的。例如，甲乙双方签订了一份借款协议，双方都在协议上签字确认，虽然没有按指印，但只要这份协议是双方自愿协商达成的，不违反法律法规，那么这份协议就是有效的。
- 有特殊约定：若协议中明确规定必须双方签字并按指印方为有效，那么缺少任一要素都可能导致协议无效。在这种情况下，如果只有签字没有按指印，且没有其他证据证明双方的真实意思表示，那么协议可能无法被认定为有效。
实践建议
- 增强证明力：为避免潜在纠纷，建议在签订重要协议时，尽量同时采用签字和按指印的方式，以增强协议的证明力和可信度。这样即使在未来出现争议，也能更容易地证明协议的真实性和有效性。
- 确保真实性：签字的真实性和合法性至关重要。应确保签字人具有相应的民事行为能力，且签字过程无欺诈、胁迫等导致意思表示不真实的情形。如果可能的话，可以在签字时录像或拍照留存证据。
- 法律审查：在签订协议前，最好对协议内容进行法律审查，确保协议内容不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗。如果对协议的效力存在疑问或涉及复杂法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见。
综上所述，民间协议只签字没按指印在大多数情况下是有效的，但具体效力需结合协议内容、当事人意愿及法律规定来判断。为确保协议的有效性和安全性，建议在签订合同时遵循相关法律法规，并考虑采取多种措施增强协议的证明力和可信度。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。