关于责任方保险公司指定修理厂是否合法的问题，这并非一个绝对合法或非法的一概而论情况，而是需要依据具体情境和合同条款来综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、合法情况
合同明确约定：
- 如果保险合同中明确规定了保险公司有权指定修理厂进行维修，并且投保人在签订合同时已明确接受此约定，那么从合同法的角度来看，保险公司的指定行为是合法的。这种情况下，投保人应遵守合同条款，按照保险公司的指定进行维修。
保障维修质量与专业性：
- 保险公司指定的修理厂通常经过严格筛选和评估，具备较高的维修资质和技术水平。在车辆内部结构损坏且理赔人员难以判断的情况下，保险公司可能会建议指定修理厂进行维修，以确保维修的准确性和专业性。然而，这仅仅是建议，车主仍然享有最终的选择权。
车主自愿选择：
- 如果车主在投保时选择了包含指定修理厂服务的特约条款，并愿意为此支付额外保费，那么车辆的维修将受此条款约束，保险公司有权指定修理厂进行维修。
二、不合法情况
侵犯消费者自主选择权：
- 根据《消费者权益保护法》，消费者享有自主选择商品或服务的权利。如果保险公司以强制手段完全剥夺被保险人自行选择有资质修理厂的权利，这种指定行为就是不合法的。例如，被保险人找到一家距离近、口碑好且具备相应维修资质的修理厂，但保险公司却强行要求其必须到指定修理厂维修，这就侵犯了消费者的自主选择权。
存在利益输送：
- 如果保险公司与指定修理厂之间存在不合理的经济关联或利益输送，导致修理厂为了获取更多业务而降低维修标准或抬高维修价格，从而损害被保险人的利益，那么这种指定行为也是违法的。
三、车主权益保护建议
仔细阅读合同条款：
- 车主在签订保险合同时应仔细阅读合同条款，了解自己的权利和义务，特别是关于修理厂指定的相关条款。
与保险公司沟通协商：
- 如果车主对保险公司指定修理厂存在疑问或认为自身权益受到侵害，可以先与保险公司进行充分沟通协商，要求其说明指定的依据和合理性。
寻求监管机构帮助或法律途径维权：
- 协商不成的，车主可以向保险行业监管机构投诉，甚至通过法律途径维护自己的合法权益。
四、总结
保险公司指定修理厂修车的行为并非绝对合法或非法，而是取决于具体情况和合同条款的约定。车主在签订保险合同时应仔细阅读合同条款，了解自己的权利和义务，以便在需要时做出正确的决策。同时，车主也应积极维护自己的合法权益，对任何侵犯自己选择权或利益的行为及时采取法律措施进行维权。