结论：打架致人轻伤二级，检察院不予起诉的案件，是否会开除党籍不能一概而论，需根据具体情节、后果及党员态度等因素综合判断。以下从不同角度详细分析：

一、法律层面：检察院不予起诉的含义

检察院不予起诉，通常意味着案件在刑事诉讼程序中未达到起诉标准，或者情节轻微，依法不需要追究刑事责任。这并不等同于无罪，而是基于法律和事实的判断，认为不需要通过刑事诉讼程序来追究被告人的刑事责任。在打架致人轻伤二级的案件中，如果检察院认为情节轻微，或者存在其他法定不起诉情形（如自首、立功、赔偿并取得谅解等），可能会作出不予起诉的决定。

二、党纪层面：开除党籍的考量因素

开除党籍是党内最严厉的纪律处分，通常适用于严重违反党的纪律，给党的事业和形象造成严重损害的党员。在打架致人轻伤二级且检察院不予起诉的案件中，是否开除党籍需考虑以下因素：

1. 情节严重程度：虽然检察院不予起诉，但打架行为本身可能违反了党的纪律，特别是如果行为性质恶劣、影响恶劣，或者造成了严重的社会后果，那么开除党籍的可能性就会增加。

2. 党员态度：党员在事件发生后的态度，包括是否主动承认错误、是否积极赔偿并取得谅解、是否配合组织调查等，都会影响党组织的处理决定。如果党员态度诚恳，积极改正错误，那么党组织可能会给予较轻的处分。

3. 党纪规定：根据《中国共产党纪律处分条例》等相关规定，对于打架斗殴等违反社会管理秩序的行为，党组织会根据情节轻重给予相应的纪律处分。如果行为构成犯罪，但依法免予刑事处罚的，或者虽不构成犯罪但情节较重的，都可能面临开除党籍等严重处分。

三、具体案例分析

在实际操作中，每个案件的具体情况都会有所不同。例如，如果打架行为是出于自卫或者是在受到严重挑衅的情况下发生的，且党员在事后积极赔偿并取得了对方的谅解，同时态度诚恳、积极配合组织调查，那么党组织可能会考虑给予较轻的处分，如警告、严重警告或者撤销党内职务等，而不是直接开除党籍。

相反，如果打架行为性质恶劣、影响恶劣，或者党员在事后态度恶劣、拒不承认错误、不配合组织调查等，那么党组织可能会认为该党员已经丧失了党员的基本条件，从而决定开除其党籍。

四、建议与提醒

1. 积极配合组织调查：无论案件结果如何，党员都应积极配合党组织的调查工作，如实陈述事实，提供相关证据。

2. 主动承认错误并改正：如果党员确实存在错误行为，应主动承认错误并积极改正，争取党组织的谅解和宽大处理。

3. 寻求法律帮助：在处理此类案件时，党员可以寻求专业律师的帮助，了解自己的权利和义务，以及可能面临的法律后果和党纪处分。

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