结论：不是一家银行的两张信用卡叠加起来透支五万额度，是否会被立案，取决于透支行为是否构成信用卡诈骗罪，具体需结合透支金额、用途、还款情况及主观恶意等因素综合判断。以下从不同角度详细分析：
一、法律对信用卡诈骗罪的规定
根据《中华人民共和国刑法》第一百九十六条，信用卡诈骗罪包括以下情形：
- 使用伪造的信用卡，或者使用以虚假的身份证明骗领的信用卡的；
- 使用作废的信用卡的；
- 冒用他人信用卡的；
- 恶意透支的。
其中，恶意透支是指持卡人以非法占有为目的，超过规定限额或者规定期限透支，并且经发卡银行催收后仍不归还的行为。
二、透支五万额度是否构成恶意透支
透支金额：
- 透支五万额度本身并不直接构成恶意透支，但属于数额较大的范畴（根据相关司法解释，恶意透支数额在五万元以上不满五十万元的，应当认定为刑法第一百九十六条规定的“数额较大”）。
透支用途与还款情况：
- 如果透支用于正常消费，且持卡人有还款意愿并正在积极还款，通常不构成恶意透支。
- 如果透支用于非法活动，或者持卡人明知无力偿还仍大量透支，且经银行催收后拒不归还，则可能构成恶意透支。
主观恶意：
- 恶意透支的关键在于持卡人是否具有非法占有的目的。如果持卡人透支后逃匿、改变联系方式以逃避银行催收，或者将透支资金用于违法犯罪活动，通常可以认定为具有非法占有的目的。
三、是否会被立案
银行催收程序：
- 在决定是否立案前，银行通常会进行多次催收，包括电话、短信、信函等方式。如果持卡人在催收后能够及时还款或与银行达成还款协议，通常不会被立案。
银行报案与公安机关立案：
- 如果持卡人经银行催收后仍不归还，且透支金额达到数额较大的标准（如五万元以上），银行可能会向公安机关报案。
- 公安机关在接到报案后，会进行初步调查，如果认为存在犯罪事实且需要追究刑事责任，会依法立案侦查。
四、建议与风险提示
及时还款：
- 如果持卡人已经透支且无力一次性偿还，建议尽快与银行沟通，制定还款计划并按时还款，以避免被认定为恶意透支。
保留证据：
- 持卡人应保留好与银行的沟通记录、还款凭证等证据，以证明自己的还款意愿和行动。
法律咨询：
- 如果持卡人对自己的透支行为是否构成恶意透支存在疑问，或者已经收到银行的催收通知或公安机关的调查通知，建议及时咨询专业律师，了解自己的法律权利和义务。
总结：不是一家银行的两张信用卡叠加起来透支五万额度，是否会被立案取决于多种因素，包括透支金额、用途、还款情况及主观恶意等。持卡人应谨慎使用信用卡，避免透支过度，并在遇到问题时及时与银行沟通并寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。