结论：店长溢价商品以标价卖出，这一行为本身并不直接违反商标权、专利权或著作权法，但具体是否违法需结合实际情况判断，比如是否存在欺诈、虚假宣传等违法行为。以下从不同角度进行分析：
一、从商标权角度分析
商标权主要保护的是商标标识的专用权，即商标所有人对其注册商标的独占使用权。店长溢价商品以标价卖出，这一行为本身并不涉及商标标识的非法使用或侵犯商标专用权的问题。除非店长在销售过程中使用了与他人注册商标相同或近似的标识，且该使用行为未经商标权人许可，否则不构成商标侵权。
二、从专利权角度分析
专利权保护的是发明创造的新颖性、创造性和实用性。店长溢价商品以标价卖出，这一行为与专利权无直接关联。除非店长销售的商品本身侵犯了他人的专利权，比如未经专利权人许可，擅自制造、使用、许诺销售、销售、进口其专利产品，或者使用其专利方法以及使用、许诺销售、销售、进口依照该专利方法直接获得的产品，否则不构成专利侵权。
三、从著作权角度分析
著作权保护的是文学、艺术和科学领域内具有独创性并能以一定形式表现的智力成果。店长溢价商品以标价卖出，这一行为本身并不涉及著作权的侵犯。除非店长在销售过程中未经著作权人许可，擅自复制、发行、表演、放映、广播、汇编、通过信息网络向公众传播其作品，或者使用其作品进行其他侵权行为，否则不构成著作权侵权。
四、从其他法律角度分析
虽然店长溢价商品以标价卖出这一行为本身不直接违反商标权、专利权或著作权法，但可能涉及其他法律问题。例如：
欺诈行为：如果店长在销售过程中故意隐瞒商品的真实情况，或者虚构事实，诱使消费者购买溢价商品，可能构成欺诈行为，违反《消费者权益保护法》等相关法律法规。
虚假宣传：如果店长在销售过程中对商品的性能、功能、质量、销售状况、用户评价、曾获荣誉等作虚假或者引人误解的商业宣传，欺骗、误导消费者，可能构成虚假宣传行为，违反《反不正当竞争法》等相关法律法规。
价格欺诈：如果店长利用虚假的或者使人误解的价格手段，诱骗消费者或者其他经营者与其进行交易，可能构成价格欺诈行为，违反《价格法》等相关法律法规。
建议：作为店长，在销售商品时应当遵守相关法律法规，确保商品的质量、价格等信息真实、准确、完整，避免欺诈、虚假宣传等违法行为的发生。如果消费者对商品价格有疑问或投诉，店长应当积极回应并妥善处理，以维护良好的市场秩序和消费者权益。
后续思考：如果您在经营过程中遇到任何与商标权、专利权、著作权相关的法律问题，或者对商品销售过程中的法律合规性有疑问，都可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。