工厂通过个人账户发工资是否合法，需分情况讨论：

1. 合法情形：

   • 特殊情况下的临时安排：如果工厂因特殊原因（如银行系统故障、紧急情况等）临时使用个人账户发放工资，且能提供充分证据证明这一行为的临时性和合理性，同时确保工资发放的金额、时间等与劳动合同或公司规定一致，这种行为可能被视为合法。但这种情况非常特殊且罕见，且工厂需承担举证责任。
   • 员工同意且不影响权益：如果员工明确同意工厂通过个人账户发放工资，并且这种发放方式没有损害员工的任何权益（如工资数额、发放时间、社保缴纳等），从民事法律关系的角度，可以视为双方对工资发放方式的合意变更。但需注意，这种合意变更不能违反法律法规的强制性规定，如不能因此逃避税务、社保等法定义务。

2. 不合法情形：

   • 逃避税务和社保义务：工厂通过个人账户发放工资，往往是为了逃避税务和社保的缴纳义务。这种行为违反了《中华人民共和国税收征收管理法》和《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，工厂可能面临税务处罚和社保补缴等法律责任。
   • 损害员工权益：如果工厂通过个人账户发放工资导致员工无法享受到应有的工资待遇（如工资被克扣、拖欠等），或者影响了员工的社保缴纳、公积金提取等权益，这种行为显然是不合法的。员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求工厂承担相应的法律责任。
   • 违反财务管理规定：工厂作为法人实体，其财务活动应受到严格的监管。通过个人账户发放工资可能违反了工厂的财务管理制度，甚至可能涉及挪用资金、贪污等违法行为。

法律建议：

• 对于工厂而言，应严格遵守国家法律法规，通过正规渠道（如银行账户）发放工资，确保员工的合法权益得到保障。同时，工厂应建立健全的财务管理制度，规范财务活动，避免不必要的法律风险。
• 对于员工而言，如果发现工厂通过个人账户发放工资，且怀疑存在违法行为，应及时向劳动监察部门投诉或咨询专业律师（即向我咨询），了解自己的权益和维权途径。在维权过程中，员工应保留好相关证据（如工资条、银行转账记录等），以便在需要时提供证明。

可能后果：

• 如果工厂通过个人账户发放工资被认定为违法行为，工厂可能面临税务处罚、社保补缴、罚款等法律责任。同时，工厂的声誉和信誉也可能受到损害，影响其未来的经营和发展。
• 对于员工而言，如果因工厂通过个人账户发放工资而遭受损失（如工资被克扣、社保未缴纳等），员工有权要求工厂承担赔偿责任。在极端情况下，如果工厂的行为构成犯罪（如挪用资金、贪污等），相关责任人还可能面临刑事处罚。