结论：换二手发动机未备案的情况下发生交通事故致人死亡，保险公司是否赔偿需分情况讨论，主要取决于保险合同条款约定、事故原因及法律责任认定。以下从三个角度展开分析：

1. 保险合同条款的效力

根据《机动车交通事故责任强制保险条例》及商业保险合同通用条款，车辆改装或变更重要部件（如发动机）未履行法定备案手续，可能构成保险免责事由。具体表现为：

• 交强险层面：交强险的赔偿范围通常不受车辆改装影响，但若改装导致车辆危险程度显著增加（如发动机功率大幅提升），且未通知保险公司，根据《保险法》第52条，保险公司可能对事故损失拒绝赔偿。
• 商业险层面：商业险合同普遍约定“车辆改装未备案导致危险程度增加，保险公司不承担赔偿责任”。若发动机更换未备案且与事故存在因果关系（如改装后刹车系统不匹配导致失控），保险公司可能拒赔。

关键点：需审查保险合同中“免责条款”是否明确约定“未备案改装不赔”，且保险公司是否尽到提示说明义务（如加粗字体、投保人签字确认）。若条款无效或未提示，保险公司仍需赔偿。

2. 事故原因与因果关系

即使发动机未备案，保险公司是否赔偿还需结合事故原因判断：

• 若事故与发动机更换无直接关联（如驾驶员酒驾、违规变道导致碰撞），保险公司通常需按合同赔偿，但可能主张追偿权（如向责任人索赔）。
• 若事故因发动机故障引发（如二手发动机存在缺陷导致失控），且未备案行为被认定为“重大过失”，保险公司可能以“危险程度增加未通知”为由拒赔，但需证明故障与未备案的因果关系。

案例参考：某法院判决中，车主更换大功率发动机未备案，后因发动机爆缸引发事故，法院认定车主未履行告知义务，保险公司商业险拒赔成立。

3. 行政处罚与民事赔偿的区分

需明确：未备案发动机属于行政违法（如《道路交通安全法》第16条），但行政违法不直接导致保险合同无效。保险公司需证明未备案行为与事故风险增加存在直接关联，才能主张免责。若仅以“未备案”为由拒赔，可能被法院认定为“格式条款无效”。

行动建议

1. 立即报案并保护现场：发生事故后第一时间报警、联系保险公司，保留现场证据（如监控、行车记录仪）。
2. 审查保险合同：重点查看“免责条款”是否包含“未备案改装”内容，并确认保险公司是否履行提示义务。
3. 咨询专业律师：结合事故责任认定书、保险合同等材料，分析保险公司拒赔理由是否成立，必要时通过诉讼维护权益。

温馨提示：车辆改装或更换重要部件后，务必到车管所办理备案手续，避免因行政违法影响保险权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律问题。