发动机更换后不备案确实可能会影响保险理赔。以下是对此问题的详细分析：
首先，我们需要明确，在保险合同有效期内，车辆的重要变更，如更换发动机，是需要通知保险公司的。这是因为发动机作为车辆的关键部件，其型号、性能的变化可能会直接影响车辆的风险状况。
一、未备案的情况
如果您在更换发动机后未通知保险公司，那么一旦车辆因发动机相关问题或其他原因出险并申请理赔，保险公司有权以您未履行如实告知义务为由，拒绝承担赔偿责任。这是因为您未将车辆的重要变更情况告知保险公司，导致保险公司无法对风险进行重新评估。
此外，未通知保险公司更换发动机还可能会影响保险合同的正常履行。保险公司有权根据具体情况对保险合同进行重新评估，并可能采取相应措施处理，如解除保险合同或调整保费等。
二、已备案的情况
如果您在更换发动机后及时通知了保险公司，并完成了相关变更手续（如发动机号变更等），那么保险合同将继续有效。此时，如果车辆发生保险事故，只要符合保险合同的约定条件，保险公司将按照正常流程进行理赔。
但需要注意的是，更换发动机后，保险公司可能会根据新发动机的情况重新核定保费。特别是如果更换为功率更大、性能更强的发动机，车辆的行驶速度和风险程度可能会相应增加，因此保费也可能会有所调整。
三、特殊注意事项
原厂与非原厂发动机的区别：更换原厂发动机且手续齐全的情况下，通常不会对保险产生太大影响。但若更换的是非原厂发动机，特别是性能、规格与原车发动机有显著差异的，保险公司可能会要求重新核定保费或限制理赔范围。
保额调整：车辆改装（包括更换发动机）后，其价值可能会有所变化。因此，建议您主动与保险公司联系，根据实际情况调整保额，以避免在出险时因保额不足而产生纠纷。
综上所述，为了确保您的保险权益不受影响，建议您在更换发动机前提前与保险公司沟通并了解相关政策。更换后务必及时办理相关变更手续，并根据车辆改装后的实际情况调整保额。与保险公司保持密切沟通是确保您权益的关键所在。