农村宅基地买卖协议书的合法性需根据具体情况进行判断，不能一概而论。以下是从不同角度对农村宅基地买卖协议书合法性的详细分析：
一、合法有效的情形
同一集体经济组织成员之间的转让：
- 条件：当买卖双方均为同一集体经济组织成员，且转让行为符合宅基地申请条件（如“一户一宅”原则），并经过本集体经济组织同意时，该宅基地买卖协议书通常被认定为合法有效。
- 实例：例如，村民甲因搬迁至城市，欲将其在农村的闲置宅基地及房屋转让给同村村民乙，且乙符合申请宅基地的条件且无宅基地。经村委会同意并办理相关手续后，该交易合法有效。
随房屋继承而转移：
- 条件：在继承农村房屋时，宅基地的使用权会随房屋一并继承，这种情况下宅基地也发生了合法转移。但继承人必须是本集体经济组织成员。
- 实例：村民丙去世后，其农村房屋及宅基地由同村村民丁继承，丁作为本集体经济组织成员，继承行为合法有效。
二、违法无效的情形
非同一集体经济组织成员之间的转让：
- 规定：农村宅基地具有福利性质，专为本集体经济组织成员提供保障性住房用地。非本集体经济组织成员不具备享受该集体土地福利的资格，因此他们之间的宅基地买卖协议书一般被认定为无效。
- 后果：此类交易无法获得法律认可和保护，双方权益均可能受损。例如，村民戊将其宅基地及房屋卖给外村村民己，该交易因违反法律规定而无效。
城镇居民与农村村民之间的转让：
- 政策：国务院办公厅及相关政策明确禁止城镇居民在农村购置宅基地。城镇居民不具有农村集体经济组织成员身份，不享有使用农村宅基地的权利。
- 后果：城镇居民与农村村民之间签订的宅基地买卖协议书通常被视为违反了国家政策和相关法律精神，从而被认定为无效合同。合同一旦无效，双方需相互返还财产，即卖方退还购房款，买方退还宅基地及地上房屋。
违反一户一宅原则或其他相关法律法规的转让：
- 原则：农村宅基地的分配遵循“一户一宅”的原则，即每户只能拥有一处宅基地。
- 后果：若转让行为违反了这一原则或其他相关法律法规（如土地管理法、城乡规划法等），则该宅基地买卖协议书同样会被认定为无效。例如，村民庚已拥有一处宅基地，又购买了村民辛的宅基地，该交易因违反“一户一宅”原则而无效。
三、实际操作中的注意事项
- 了解法律法规：在进行宅基地相关交易时，务必了解清楚相关法律法规和政策要求，确保交易的合法性和安全性。
- 办理相关手续：宅基地买卖需经过集体经济组织同意，并签订书面合同，明确双方的权利和义务。同时，需办理相关宅基地变更登记手续，以确保交易的合法性和有效性。
- 保留证据文件：对于任何涉及宅基地的交易行为，都应保留好相关证据和文件，以便在必要时维护自己的合法权益。
总结与建议：农村宅基地买卖协议书的合法性取决于多种因素，包括买卖双方的身份、转让条件是否符合法律规定以及是否办理了相关手续等。在进行宅基地买卖时，建议务必谨慎行事，确保交易的合法性和安全性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。