关于“排除妨害”与“占有排除妨害”的基础矛盾区别，以及占有人是否要求合法的问题，可以总结如下：
基础矛盾与区别：
- 排除妨害：这是一个更广泛的概念，通常指的是权利人（如物权人）在其权利受到不法妨害时，有权请求妨害人停止侵害、排除妨碍，以恢复其权利的圆满状态。这里的“妨害”可以是任何非法行为，包括但不限于侵占、破坏、污染等。
- 占有排除妨害：这是针对占有这一特定法律状态的保护。占有，无论是否合法，都受到法律一定程度的保护。当占有人的占有受到不法妨害时，占有人有权请求排除妨害。这里的重点在于保护占有的稳定性，而非占有的合法性。
- 区别：主要在于保护的对象和侧重点不同。排除妨害保护的是权利人的物权或其他权利，而占有排除妨害则更侧重于保护占有的事实状态，无论该占有是否合法。
占有人是否要求合法：
- 占有排除妨害中的占有人：在占有排除妨害的语境下，占有人并不要求必须是合法占有人。即使占有人是无权占有（如通过盗窃、侵占等方式取得占有），其占有状态也受到法律一定程度的保护，以防止他人以不法手段破坏其占有。当然，这种保护并不意味着承认或保护非法占有的权利，而是为了维护社会秩序和交易安全。
- 合法占有人与非法占有人的区别：虽然非法占有人也有权请求排除妨害，但其权利范围可能受到限制。例如，非法占有人可能无法主张因占有而产生的某些权益（如占有使用费），且在面临权利人追索时，可能需要返还占有物。而合法占有人则享有更全面的保护，包括主张占有使用费、在占有物受到损害时请求赔偿等。
进一步说明与建议：
- 在实际应用中，区分排除妨害与占有排除妨害的关键在于明确请求权的基础。如果是基于物权或其他权利受到妨害而提出的请求，则属于排除妨害；如果是基于占有状态受到妨害而提出的请求，则属于占有排除妨害。
- 对于占有人而言，无论其占有是否合法，都有权在受到不法妨害时寻求法律保护。但非法占有人应意识到其权利可能受到限制，并应积极采取措施将占有转化为合法占有（如通过购买、租赁等方式），以更好地保护自己的权益。
- 在处理涉及排除妨害或占有排除妨害的案件时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。律师可以根据案件的具体情况，分析请求权的基础、占有的合法性以及可能面临的法律后果等因素，为当事人提供全面的法律支持。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您有任何其他法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。