如果已经被法院申请执行但钱已经还了，你可以按照以下步骤来处理：
及时与执行法院联系：
- 首先，你需要尽快与负责执行你案件的法院取得联系，告知他们你已经履行了还款义务。这是最直接且有效的方式，可以确保法院及时了解你的还款情况，并停止进一步的执行措施。
提供还款证据：
- 在与法院沟通时，你需要提供充分的证据来证明你已经还清了债务。这些证据可以包括银行转账记录、收据、还款协议等。确保这些证据是真实、合法且有效的，以便法院能够迅速确认你的还款事实。
申请执行终结或撤销执行申请：
- 一旦法院确认你已经履行了还款义务，你可以向法院申请终结执行程序或撤销执行申请。法院会根据实际情况作出相应的裁定，并停止进一步的执行措施。
关注执行进展并保留相关文件：
- 在整个过程中，你需要密切关注执行的进展情况，并保留好所有与还款和执行相关的文件。这些文件可能在后续需要作为证明你已还款的证据，或者用于处理可能出现的任何争议。
可能遇到的法律后果及建议：
如果未及时与法院沟通：
- 如果你未及时与法院沟通并说明还款情况，法院可能会继续执行程序，包括冻结你的银行账户、查封你的财产等。这将给你带来不必要的麻烦和损失。因此，及时与法院沟通是至关重要的。
如果还款证据不足：
- 如果你提供的还款证据不足或存在争议，法院可能无法确认你的还款事实。在这种情况下，你可能需要进一步提供证据或通过法律途径解决争议。因此，在还款时务必保留好所有相关证据，并确保其真实、合法且有效。
如果执行程序已启动但已还款：
- 即使执行程序已经启动，但只要你已经履行了还款义务，你仍然有权向法院申请终结执行程序或撤销执行申请。法院会根据实际情况作出相应的裁定，并保护你的合法权益。
额外建议：
- 在未来的借贷或交易中，建议你与对方签订明确的还款协议，并保留好所有相关证据。这样可以在出现争议时提供有力的证明，保护你的合法权益。
- 如果你对执行程序或相关法律问题有任何疑问或担忧，你可以随时向我咨询。我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。