刑事案件中公益诉讼的诉讼程序与注意事项，可以归纳为以下几个方面：
一、诉讼程序
立案：
- 检察机关在履行职责过程中，发现存在破坏生态环境和资源保护、食品药品安全领域侵害众多消费者合法权益等损害社会公共利益的犯罪行为时，会进行初步审查。
- 符合立案条件的，检察机关会予以立案，并启动刑事附带民事公益诉讼程序。
调查取证：
- 检察机关会依法收集证据，包括物证、书证、证人证言等，以证明犯罪行为的存在及其对社会公共利益造成的损害。
- 调查取证过程中，检察机关可能会运用多种手段，如现场勘查、询问当事人、委托鉴定等。
诉前程序：
- 在提起诉讼前，检察机关会先向相关行政机关发出检察建议，督促其履行职责，采取措施修复受损的社会公共利益。
- 若行政机关未依法处理或处理不当，检察机关则会提起诉讼。
提起诉讼：
- 检察机关会向人民法院提交起诉状，明确诉讼请求和事实依据，要求犯罪嫌疑人或被告人在承担刑事责任的同时，还需承担相应的民事赔偿责任。
- 法院受理案件后，会按照法定程序进行审理，并作出判决。
审理与判决：
- 案件由人民法院同一审判组织进行审理，确保刑事与民事部分的协调统一。
- 法院在审理过程中，不仅会对被告人的刑事行为进行定罪量刑，还会对其损害社会公共利益的行为进行民事责任的判定。
- 判决可能包括刑罚处罚（如有期徒刑、罚金等）和民事赔偿（如停止侵害、恢复原状、赔偿损失等）。
二、注意事项
公益诉讼与刑事案件审级、刑罚的关系：
- 刑事附带民事公益诉讼并非决定刑事案件审级高低或刑罚轻重的关键要素。刑事案件的严重程度主要取决于罪行的恶劣程度、情节及造成的危害。
- 公益诉讼的重点在于修补被破坏的公共利益，法院在定罪判刑的同时，还需考虑如何弥补罪犯行为对社会公共利益造成的损失。
赔偿范围的确定：
- 公益诉讼的赔偿范围广泛，包括但不限于生态环境损害修复期间服务功能丧失导致的损失、永久性损害造成的损失、调查鉴定评估费用、清除污染和修复生态环境的费用以及预防损害发生和扩大所支出的合理费用。
- 在确定赔偿范围时，需要充分考虑罪犯行为的性质、情节以及造成的实际损害。
提起主体的资格：
- 在我国，检察机关是提起刑事案件公益诉讼的主要主体。作为国家法律监督机关，检察机关具有代表国家和社会公共利益提起诉讼的职责和能力。
- 在特定情况下，法律规定的机关和有关组织也可以依法向人民法院提起诉讼，此时检察机关可以提供支持起诉。
证据的收集与保存：
- 在公益诉讼中，证据的收集与保存至关重要。检察机关需要依法收集能够证明犯罪行为存在及其对社会公共利益造成损害的证据。
- 证据应当真实、合法、有效，并能够在法庭上得到认可。因此，在收集证据时，需要严格遵守法定程序，确保证据的合法性和有效性。
举例说明：
假设某企业非法排放危险废物，严重污染了周边环境，对当地居民的健康造成了威胁。检察机关在履行职责过程中发现了这一犯罪行为，并进行了初步审查。符合立案条件后，检察机关予以立案，并启动了刑事附带民事公益诉讼程序。在调查取证过程中，检察机关收集了物证、书证、证人证言等证据，证明了企业的犯罪行为及其对环境造成的损害。在诉前程序中，检察机关向相关行政机关发出了检察建议，但行政机关未依法处理。于是，检察机关向人民法院提起了诉讼，要求企业承担刑事责任的同时，还需承担民事赔偿责任。法院受理案件后，经过审理作出了判决，对企业处以了刑罚处罚，并要求其承担清除污染、修复生态环境的费用以及赔偿当地居民因环境污染造成的损失。
总结与建议：
刑事案件中的公益诉讼是保护社会公共利益、打击犯罪行为的有力武器。通过检察机关的积极参与和司法程序的严格执行，我们能够有效追究犯罪者的责任，修复受损的公共利益。在参与公益诉讼时，需要注意赔偿范围的确定、提起主体的资格以及证据的收集与保存等问题。如果您在刑事案件公益诉讼方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。