当行政复议申请超期时，处理方式确实需要结合具体情形和法律规定来综合判断。以下是我为您详细梳理的处理流程及建议：
一、明确行政复议的申请期限
首先，我们需要了解行政复议的基本申请期限。根据《中华人民共和国行政复议法》的相关规定，公民、法人或者其他组织认为具体行政行为侵犯其合法权益的，通常可以自知道该具体行政行为之日起六十日内提出行政复议申请。但请注意，如果法律规定的申请期限超过六十日，那么应遵循该特别规定。另外，如果因不可抗力（如自然灾害、战争等）或其他正当理由（如疾病、交通中断等）耽误了法定申请期限，申请期限会自障碍消除之日起继续计算。
二、分析超期原因及处理方式
无正当理由超期：
- 如果申请人无正当理由超过了法定的申请期限，行政复议机关通常会依法不予受理。这是因为行政复议制度旨在及时纠正违法的或不当的具体行政行为，保护公民、法人和其他组织的合法权益，而超期申请可能影响到行政行为的稳定性和可预测性。
因不可抗力或其他正当理由超期：
- 如果申请人因不可抗力或其他正当理由耽误了法定申请期限，可以在障碍消除后的十日内向行政复议机关说明情况，并提供相关证明材料，申请延长期限。行政复议机关在审查后，如果认为理由正当，可能会决定受理复议申请。
行政机关未履行告知义务导致的超期：
- 如果行政机关在作出具体行政行为时，未告知公民、法人或其他组织申请行政复议的权利、行政复议机关和申请期限，那么申请期限将从公民、法人或其他组织知道或应当知道这些信息之日起计算。但最长不得超过一年。
三、超期申请后的补救措施
与行政复议机关沟通：
- 即使申请超期，申请人仍可以尝试与行政复议机关进行沟通，解释超期的原因，并请求行政复议机关考虑特殊情况给予受理。虽然这种情况下行政复议机关受理的可能性较小，但沟通有助于了解行政复议机关的态度和可能的解决方案。
寻求其他法律救济途径：
- 如果行政复议申请被驳回或不予受理，申请人可以考虑通过行政诉讼等其他法律途径来维护自己的合法权益。根据《中华人民共和国行政诉讼法》的规定，公民、法人或其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。
四、注意事项
保留相关证据：
- 无论采取何种方式处理超期申请的问题，申请人都应保留好相关证据材料，如邮寄凭证、沟通记录、证明材料等，以备不时之需。
及时咨询专业律师：
- 行政复议和行政诉讼涉及复杂的法律程序和专业知识，建议申请人在遇到问题时及时咨询专业律师的意见和帮助，以确保自己的权益得到充分保护。
综上所述，当行政复议申请超期时，申请人应首先分析超期的原因，并根据具体情况采取相应的处理方式。同时，保留好相关证据并及时咨询专业律师也是非常重要的。希望这些建议能对您有所帮助。