结论：关于2003年村集体让村民用基本农田换村集体山坡机动地退耕还林是否合法的问题，这主要取决于当时的法律法规、政策规定以及具体的操作程序是否合规。以下从几个方面进行详细分析：
基本农田保护原则：
- 根据我国相关法律法规，基本农田是受到严格保护的，不得随意占用或改变用途。如果村集体在未经合法程序的情况下，擅自决定用基本农田进行退耕还林，这很可能违反了基本农田保护的原则。
退耕还林政策与程序：
- 退耕还林是一项重要的生态保护政策，但必须遵循严格的程序和规定。通常，这需要经过上级政府的批准，并确保退耕还林的土地符合政策要求，且不会损害农民的合法权益。
- 如果村集体在未经批准或未按照规定程序进行的情况下，擅自进行土地置换和退耕还林，那么这种行为可能是不合法的。
土地置换的合法性：
- 土地置换涉及土地权属的变更，必须遵循相关法律法规的规定。这通常包括土地权属的确认、置换协议的签订、土地登记的变更等程序。
- 如果村集体在土地置换过程中未遵循这些程序，或者置换协议存在不公平、不合理的情况，那么这种土地置换可能是无效的，甚至可能构成违法行为。
村民权益的保护：
- 在进行土地置换和退耕还林时，必须充分保护村民的合法权益。这包括确保村民对置换土地的知情权、参与权、决策权以及获得合理补偿的权利。
- 如果村集体在操作过程中忽视了村民的权益，或者未给予村民合理的补偿，那么这种行为可能是不合法的，甚至可能引发法律纠纷。
建议：
- 鉴于上述分析，如果您认为村集体的行为可能违反了相关法律法规或政策规定，或者损害了您的合法权益，我建议您首先收集相关证据，如土地置换协议、退耕还林的相关文件、村民会议记录等。
- 然后，您可以向当地的土地管理部门或农业部门进行咨询和投诉，寻求他们的帮助和指导。
- 如果问题无法得到妥善解决，您还可以考虑通过法律途径来维护自己的权益，比如提起行政诉讼或民事诉讼。
后续行动：
- 在采取任何行动之前，我建议您先详细了解当时的法律法规和政策规定，以及具体的操作程序是否合规。
- 如果您需要进一步的法律帮助或咨询，请随时向我提问，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议和指导。