在虚开案件立案前已经补税的，一般不能直接扣减虚开税款数额，但可能作为量刑情节考虑。以下从不同角度进行分析：
一、虚开税款数额的认定
虚开税款数额是虚开增值税专用发票罪的重要定罪量刑依据。根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条及相关司法解释，虚开税款数额的大小直接决定了犯罪的严重程度和相应的刑罚。在虚开案件中，税务机关或司法机关会依据虚开的发票金额、税率等因素，计算出虚开的税款数额，并以此作为定罪量刑的基础。
二、补税行为对虚开税款数额的影响
补税不能直接扣减虚开税款数额：
- 补税是纳税人发现自身存在税务问题后，主动向税务机关补缴税款的行为。虽然补税体现了纳税人的悔过态度，但它并不能直接改变虚开税款数额的事实。虚开税款数额是基于虚开的发票金额和税率计算得出的，与补税行为无关。
补税可能作为量刑情节考虑：
- 在虚开案件中，如果纳税人在立案前已经补缴了税款，这一行为可能被视为悔过表现，从而在量刑时得到一定的从轻或减轻处罚。但具体是否从轻或减轻处罚，以及减轻的幅度，需要由司法机关根据案件的具体情况、纳税人的悔过程度、补税的及时性等因素进行综合判断。
三、补税行为的法律意义
减少国家税收损失：
- 补税行为有助于减少国家税收的损失，维护税收秩序的稳定。对于纳税人而言，及时补缴税款也是履行其纳税义务的重要体现。
影响司法机关的裁量：
- 如前所述，补税行为可能作为量刑情节被司法机关考虑。在虚开案件中，如果纳税人能够积极补缴税款，并表现出真诚的悔过态度，司法机关可能会在量刑时给予一定的从轻或减轻处罚。
四、建议
及时补缴税款：
- 如果纳税人发现自己存在虚开发票等税务问题，应尽快向税务机关补缴税款，以减少国家税收损失并体现自己的悔过态度。
配合司法机关调查：
- 在虚开案件中，纳税人应积极配合司法机关的调查工作，如实提供相关证据和资料，以便司法机关能够准确认定案件事实并作出公正的判决。
寻求专业法律帮助：
- 由于虚开案件涉及复杂的法律问题和税务问题，纳税人可以寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益。
如有任何关于金融保险（税务及发票）领域的法律问题，可以直接向我咨询。