子公司修改公司章程是否可以直接上股东会，需视具体情况而定，以下分情况讨论：
子公司为有限责任公司且股东单一（即母公司全资控股）的情况
- 在此情况下，子公司修改公司章程通常可以直接由母公司（即唯一股东）作出决定，无需召开子公司股东会。因为根据《公司法》及相关规定，全资子公司的股东会职权可由母公司行使，母公司有权直接决定子公司的重大事项，包括修改公司章程。但需注意，这一操作应符合子公司章程及母公司内部决策程序的要求，确保决策的合法性和有效性。
子公司为有限责任公司且股东多元的情况
- 若子公司存在多个股东，则修改公司章程需遵循《公司法》及子公司章程的规定。通常情况下，修改公司章程属于股东会的特别决议事项，需经代表三分之二以上表决权的股东通过。因此，在此情况下，子公司修改公司章程不能直接由某一股东或部分股东决定，而需召开股东会，并按照法定程序进行表决。
子公司为股份有限公司的情况
- 对于股份有限公司而言，修改公司章程同样属于股东大会的特别决议事项。根据《公司法》的规定，股份有限公司修改公司章程需经出席股东大会的股东所持表决权的三分之二以上通过。因此，在股份有限公司中，修改公司章程也不能直接由某一股东或管理层决定，而需通过股东大会进行表决。
法律建议：
- 在实际操作中，无论子公司是有限责任公司还是股份有限公司，无论股东结构如何，修改公司章程都应严格遵循《公司法》及子公司章程的规定，确保决策程序的合法性和有效性。
- 若子公司为全资子公司，母公司可直接行使股东会职权决定修改章程，但仍需确保符合母公司内部决策程序和子公司章程要求。
- 若子公司存在多个股东或为股份有限公司，则应按照法定程序召开股东会或股东大会进行表决，确保所有股东的知情权、参与权和表决权得到充分保障。
可能法律后果：
- 若未按照法定程序修改公司章程，可能导致修改行为无效，进而影响子公司的正常运营和股东权益。
- 在极端情况下，若因修改公司章程引发股东纠纷或法律诉讼，可能给子公司和母公司带来不必要的法律风险和经济损失。
因此，在修改子公司公司章程时，务必谨慎操作，确保符合法律法规和公司章程的要求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。