合作期间一方所负债务的处理需根据债务性质、合作协议约定及法律规定综合判断，核心结论如下：

1. 区分债务性质：个人债务还是共同债务

   • 个人债务：若债务系一方在合作期间以个人名义超出合作经营范围、未用于共同经营或未获另一方同意的债务（如个人消费、个人投资失败等），原则上由负债方自行承担。
     法律依据：根据《民法典》第1064条，夫妻共同债务需满足“共债共签”或“家庭共同生活需要”等条件，类比至合作场景，若债务未用于合作事务，另一方无偿还义务。
     
   • 共同债务：若债务因合作经营产生（如采购原材料、支付员工工资、偿还合作贷款等），且另一方知情或受益，则属于共同债务，双方需承担连带清偿责任。
     例外情形：若合作协议明确约定债务承担比例（如按出资比例分担），则按约定执行；但对外仍需先以合作财产清偿，不足部分再按内部比例追偿。

2. 合作协议的优先效力

   • 若合作协议中明确约定了债务承担方式（如“一方对外借款需另一方书面同意，否则自行承担”），则优先按协议处理。
     风险提示：协议约定不得违反法律强制性规定（如恶意逃避债务），否则可能被认定无效。

3. 举证责任分配

   • 主张债务为个人债务的一方，需证明债务未用于合作事务（如提供资金流向证明、合作事务记录等）；
     
   • 主张共同债务的一方，需证明债务与合作经营直接相关（如合同、发票、合作决策记录等）。

4. 实务建议

   • 事前预防：在合作协议中明确债务承担规则（如禁止一方擅自对外借款、约定担保条款等），并留存决策记录；
     
   • 事中管理：建立共同账户或财务监管机制，确保资金流向透明；
     
   • 事后救济：若发生纠纷，及时固定证据（如聊天记录、转账记录等），并通过诉讼或仲裁主张权利。

总结：合作期间债务处理需结合债务性质、协议约定及证据情况综合判断，建议提前通过协议明确规则，并在纠纷发生时委托律师分析证据链，制定诉讼策略。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。