值班时擅离职守，可能会面临以下几种后果：
违反公司规章制度：
- 大多数公司都会制定明确的规章制度，要求员工在值班期间必须坚守岗位，不得擅离职守。如果违反这一规定，公司有权根据内部规章制度对员工进行相应的纪律处分，如警告、罚款、降职甚至解雇。这种处分通常会在公司的员工手册或相关规章制度中有明确规定。
承担民事责任：
- 如果因擅离职守导致公司遭受经济损失，如设备损坏、客户流失等，员工可能需要承担一定的民事赔偿责任。这取决于具体的情况和公司的损失程度，以及员工在擅离职守时的主观过错程度。
影响工伤认定和赔偿：
- 在工伤认定方面：如果员工在值班期间擅离职守并发生事故，这可能会影响工伤的认定。根据《工伤保险条例》的规定，工伤的认定需要满足“工作时间、工作场所、因工作原因”三个条件。如果员工擅离职守，可能被视为不在工作状态，从而影响工伤的认定。但具体是否构成工伤，还需根据事故发生的具体情况、员工擅离职守的性质以及相关法律法规进行综合判断。
- 在工伤赔偿方面：如果员工被认定为工伤，但因其擅离职守的行为对事故的发生或损失的扩大有过错，那么根据《民法典》中关于过错责任的原则，员工可能需要承担一定的责任，这可能会影响其最终获得的工伤赔偿金额。具体来说，如果员工的过错行为与工伤事故的发生或损失扩大有直接因果关系，那么其获得的赔偿可能会相应减少。
面临刑事责任（极端情况下）：
- 在极端情况下，如果员工擅离职守的行为导致了严重的后果，如重大安全事故、人员伤亡等，且该行为被认定为犯罪行为（如玩忽职守罪），那么员工可能需要承担刑事责任。但这通常需要满足非常严格的条件，并且需要司法机关进行认定。
建议：
- 作为员工，应严格遵守公司的规章制度，特别是在值班期间，不得擅离职守，以确保工作的正常进行和公司的安全。
- 如果因特殊原因需要离开岗位，应提前向上级领导请假并获得批准，同时安排好工作交接，确保工作的连续性。
- 如果不幸发生工伤事故，应及时向公司报告，并按照公司的流程进行工伤认定和赔偿申请。同时，保留好相关证据，以便在需要时维护自己的合法权益。
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