甲乙双方写的协议是否合法，主要取决于该协议是否满足法律规定的生效条件。以下是从多个角度对这一问题的详细分析：
一、协议生效的法定条件
合同主体具备民事行为能力：
- 签订协议的自然人必须年满十八周岁且具有完全民事行为能力，或虽未满十八周岁但以自己劳动收入为主要生活来源，视为具有完全民事行为能力。
- 法人和非法人组织需在其核准登记的经营范围内或依法可从事的民事活动范围内签订合同。
意思表示真实：
- 双方签订协议时，必须基于真实意愿，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。若一方以威胁等方式迫使另一方签订协议，该协议在受胁迫方主张撤销时可能会被法院认定无效。
内容合法且不违背公序良俗：
- 协议内容必须符合法律、行政法规的规定，不得涉及非法活动，如毒品交易、赌博等。
- 协议内容不得违背公共秩序和善良风俗，如限制他人人身自由的“合同”即使双方签字也因违背公序良俗而无效。
形式符合要求：
- 手写协议通常无需特定形式，但应保证字迹清晰、双方签字或盖章，并建议按手印以增加法律效力。
- 若法律、行政法规规定或当事人约定合同应采用书面形式订立，则必须遵守。如建设工程合同等特定类型合同，即使手写也需确保符合相关法律规定的形式要求。
二、协议合法性的具体判断
- 审查协议内容：仔细阅读协议条款，确保没有违反法律、行政法规的强制性规定，也没有违背公序良俗的内容。
- 核实主体资格：确认签订协议的双方是否具备相应的民事行为能力，如自然人是否年满十八周岁，法人或非法人组织是否在其经营范围内签订合同。
- 评估意思表示：分析双方签订协议时是否存在欺诈、胁迫等情形，确保协议是基于双方真实意愿签订的。
三、协议合法性的法律后果
- 若协议合法有效：则对双方均具有约束力，双方应按照协议约定履行各自的义务。如一方未按时履行义务，另一方有权要求其承担违约责任。
- 若协议无效或可撤销：则协议自始不具有法律效力，双方无需按照协议约定履行义务。如因协议无效或可撤销给一方造成损失的，受损方有权要求过错方承担赔偿责任。
四、建议与注意事项
- 在签订协议前：建议双方充分沟通，明确各自的权利和义务，确保协议内容真实、合法、有效。
- 在签订协议时：注意保留好协议原件，并可以考虑拍照、复印等方式留存备份。同时，建议双方在协议中明确争议解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。
- 在履行协议过程中：如遇到问题或争议，应及时与对方沟通协商，寻求解决方案。如无法协商解决，可以寻求法律途径维护自己的合法权益。
总结来说，甲乙双方写的协议是否合法，需要综合考虑协议主体资格、意思表示、内容合法性以及形式要求等多个方面。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。