结论：租赁厂房合同中约定“乙方违法承担所有责任”这一条款，其法律效力需结合具体违法情形、合同条款的具体内容以及相关法律法规进行综合判断。在一般情况下，若该条款不违反法律强制性规定，且双方意思表示真实，则该条款具有法律效力；但若该条款存在违法或显失公平的情形，则可能被认定为无效或部分无效。
详细分析：
合同条款的基本法律效力：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法成立的合同，对当事人具有法律约束力。当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。因此，若租赁厂房合同中的“乙方违法承担所有责任”条款是双方真实意思的表示，且不违反法律、行政法规的强制性规定，那么该条款在合同双方之间是具有法律效力的。
违法情形的具体分析：
- 这里的“违法”需要明确具体是指违反何种法律。如果乙方违反的是合同中的特定条款（如未按时支付租金、擅自改变厂房结构等），且这些条款本身不违法，那么乙方承担相应责任是合理的。
- 如果乙方违反的是法律法规的强制性规定（如非法排放污染物、非法占用土地等），那么乙方不仅需要承担合同中的责任，还可能面临行政处罚或刑事责任。在这种情况下，合同中的“乙方违法承担所有责任”条款可能无法完全涵盖乙方应承担的所有法律责任，因为行政责任和刑事责任是由国家机关依法追究的，不受合同条款的约束。
条款的公平性与合理性：
- 合同条款应当遵循公平原则，确定各方的权利和义务。如果“乙方违法承担所有责任”这一条款过于苛刻，导致乙方在合同中处于明显不利的地位，那么该条款可能因显失公平而被认定为无效或部分无效。
- 例如，如果乙方因轻微违约（如迟到几天支付租金）就需要承担极其严重的后果（如承担所有法律责任、支付巨额违约金等），那么这种条款显然是不公平的，可能不会被法院支持。
法律建议：
- 对于甲方（出租方）而言，在拟定租赁合同时，应当明确约定乙方的违约责任和违法责任，但应确保这些条款合法、合理且公平。避免使用过于模糊或苛刻的条款，以免引发纠纷或导致条款无效。
- 对于乙方（承租方）而言，在签订租赁合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于违约责任和违法责任的条款。如有疑问或认为条款不公平，应及时与甲方协商修改或寻求法律帮助。
后续行动建议：
- 如果双方对合同条款存在争议或无法达成一致意见，建议通过协商、调解或诉讼等合法途径解决纠纷。
- 在处理租赁合同纠纷时，应充分收集证据（如合同文本、支付凭证、沟通记录等），以便在争议解决过程中维护自己的合法权益。
如有任何具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。