针对水厂工人私拿次品水的处理方式，需结合行为性质、公司制度及法律规定综合判断，具体处理建议如下：

1. 明确行为性质
   首先需判断工人行为属于“私拿”还是“盗窃”。若次品水属于公司明确允许员工处理的废弃物（如已标注不可饮用、准备销毁的废水），且工人未违反公司规定私自取用，可能仅涉及内部管理问题；但若次品水仍具有使用价值（如可二次利用或销售），或公司明确禁止员工私自取用任何产品，则可能涉嫌盗窃公司财物。

2. 依据公司制度处理

   • 内部调查：公司应先通过监控、证人证言等核实事实，确认工人取用次品水的频率、数量及用途。
     
   • 制度适用：若公司规章制度明确禁止员工私自取用公司财物（包括次品），可依据制度给予警告、扣罚奖金、解除劳动合同等处罚；若制度未明确规定，需谨慎处理，避免因处罚无依据引发劳动争议。
     
   • 损失追偿：若工人行为导致公司经济损失（如次品水被转卖），公司可要求其赔偿，但需提供损失证据（如市场价值、销售记录等）。

3. 法律风险评估

   • 治安管理处罚：若次品水价值较低（通常不足1000元），可能不构成刑事犯罪，但违反《治安管理处罚法》第49条，可处5-15日拘留及罚款。
     
   • 刑事责任：若次品水价值达到盗窃罪立案标准（各地标准不同，通常1000-3000元以上），或工人多次盗窃，可能涉嫌《刑法》第264条盗窃罪，面临3年以下有期徒刑、拘役或管制。
     
   • 职务侵占风险：若工人利用职务便利将次品水据为己有（如负责处理次品的员工直接截留），可能涉嫌职务侵占罪，但需次品水属于公司财物且价值达到立案标准。

4. 处理建议

   • 优先协商：若次品水价值低且为初犯，可要求工人返还财物、书面检讨，并加强制度培训。
     
   • 依法处罚：若行为恶劣或涉及金额较大，立即报警并配合调查，同时固定证据（如监控、证人、次品水价值证明等）。
     
   • 完善管理：修订公司制度，明确次品水处理流程及员工权限，避免类似事件再次发生。

提示：具体处理需结合次品水的实际价值、工人行为动机及公司制度，建议先通过内部调查固定证据，再根据情节轻重选择协商、处罚或报警。如有疑问，可进一步向我咨询细节。