农村房屋转让合同协议书是否具有法律效应，需根据具体情况综合判断。以下是对该问题的详细分析：
有效的情况
同一集体经济组织成员之间的转让
- 法律依据：依据《中华人民共和国土地管理法》第六十二条，同一集体经济组织内部的成员之间进行宅基地及房屋的转让是合法的，前提是转让行为经过了集体经济组织的同意，并且受让方符合宅基地申请条件。
- 实例说明：若甲（本村村民）因城市定居需将农村房屋转让给乙（同村村民），双方签订转让协议并明确相关事项。只要该转让得到集体经济组织批准，且乙满足宅基地使用条件，此协议即为有效。
符合相关规划和审批手续
- 法律依据：按照《村庄和集镇规划建设管理条例》第十八条，农村村民建房需先向集体经济组织提出申请，并经村民会议讨论通过，随后按程序办理审批手续。若房屋转让也遵循了类似的规划审批流程，则转让协议有效。
- 实例说明：在新农村建设规划中，若村民需搬迁并转让房屋，只要双方按规定办理了规划审批手续（如取得规划许可证、用地审批等），转让协议即为有效。
无效的情况
向非本集体经济组织成员转让
- 法律依据：宅基地属于农民集体所有，非本集体经济组织成员无权取得宅基地使用权。因此，与非本集体经济组织成员签订的房屋转让协议通常无效。
- 实例说明：若城市居民丙购买某农村村民丁的房屋并签订转让协议，由于丙不属于该农村集体经济组织成员，此协议因违反法律强制性规定而无效。
违反“一户一宅”规定
- 法律依据：“一户一宅”是我国农村宅基地管理的基本原则。若受让方已拥有一处宅基地，再通过转让协议获得另一处宅基地，则此转让协议可能因违反“一户一宅”规定而无效。
- 实例说明：若村民戊已拥有一处宅基地及房屋，又与另一村民签订协议购买其房屋，此协议可能因违反“一户一宅”原则而被认定无效。
未经集体经济组织同意
- 法律依据：宅基地的所有权属于农村集体经济组织，其对宅基地的使用和流转有管理和审批权。未经集体经济组织同意的房屋转让协议可能因违反相关程序而无效。
- 实例说明：若村民己未经村集体经济组织同意，擅自将房屋转让给同村村民庚并签订转让协议，后来村集体经济组织表示反对，则此协议可能因未经同意而被认定无效。
签订协议前的建议
在签订农村房屋转让协议前，务必确认以下几点：
- 转让双方身份：确认双方是否属于同一集体经济组织成员，或受让方是否符合宅基地申请条件。
- 协议内容合法性：确保协议内容未违反法律强制性规定，如“一户一宅”原则。
- 审批手续：确认是否已履行了必要的审批手续，如规划许可证、用地审批等。
若您对农村房屋转让合同协议书的法律效力仍有疑问，或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供详细的法律意见和指导。