加盟工程分公司是否合法，需分情况讨论：

1. 若以合法形式加盟，且满足相关条件，则是合法的

   • 合法形式与条件：加盟工程分公司，本质上可以理解为总公司设立分公司的一种形式。根据《中华人民共和国公司法》第十四条，公司有权设立分公司，但需向公司登记机关申请登记并领取营业执照。分公司作为总公司的附属机构，不具有独立的法人资格，其民事责任由总公司承担。因此，在依法依规的前提下，通过合法程序设立并加盟工程分公司是合法的。
   • 具体条件：
     • 总公司需具备建筑行业相关的合法资质，如施工总承包资质、专业承包资质等，这是分公司能够合法开展建筑业务的基础。
     • 分公司必须向所在地的公司登记机关提交必要的登记文件，如登记申请书、公司章程以及加盖公司印章的《企业法人营业执照》复印件等，完成登记注册手续并领取营业执照。
     • 分公司应配备足够数量的专业技术人员和管理人员，并确保他们持有相应的资格证书。同时，根据业务需求，分公司还需具备必要的施工设备和工具。

2. 若以非法形式加盟，如借用资质、违规操作等，则是不合法的

   • 非法形式与风险：如果加盟工程分公司是通过借用总公司资质、违规操作等方式进行，那么这种行为是违法的。根据《中华人民共和国建筑法》第六十六条，建筑施工企业转让、出借资质证书或者以其他方式允许他人以本企业的名义承揽工程的，将面临责令改正、没收违法所得、罚款、停业整顿、降低资质等级甚至吊销资质证书的严重后果。
   • 防范措施：为避免非法加盟的风险，应严格遵守相关法律法规，确保加盟过程合法合规。具体来说，应确保总公司具备合法资质，分公司完成登记注册手续，并配备足够的专业技术人员和管理人员。同时，应建立健全的管理制度，加强人员培训和管理，确保工程质量安全。

法律建议：

• 在加盟工程分公司前，务必对总公司的资质、信誉和经营状况进行全面了解，确保加盟的合法性和可行性。
• 严格按照相关法律法规和程序进行加盟操作，避免违规行为带来的法律风险。
• 在加盟过程中，应签订详细的加盟合同，明确双方的权利和义务，以保障自身合法权益。

可能后果：

• 如果以非法形式加盟工程分公司，可能面临法律制裁，包括罚款、停业整顿、降低资质等级甚至吊销资质证书等。
• 非法加盟还可能对总公司的声誉和经济利益造成严重影响，甚至引发法律纠纷。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。