针对烟草证变更法人而原法人不配合的情况，您可以按照以下步骤处理：
明确变更的法律依据与程序：
- 根据《烟草专卖许可证管理办法》及相关规定，烟草专卖许可证的变更需要遵循一定的程序，包括提交申请、提供相关证明材料等。若原法人不配合，首先应确认变更的合法性与必要性，并准备好所有必要的文件和证据，如公司决议、新法人的身份证明等。
尝试协商与沟通：
- 在采取法律手段之前，建议先尝试与原法人进行协商，了解其不配合的具体原因，并寻求解决方案。通过友好沟通，可能能够达成共识，使变更过程顺利进行。
寻求行政协助或调解：
- 如果协商无果，您可以向当地烟草专卖局或相关行政部门寻求协助，说明情况并请求他们介入调解。行政部门有权对烟草专卖许可证的变更进行监督和管理，他们的介入可能有助于解决问题。
考虑法律途径：
- 提起诉讼：若上述方法均无法解决问题，您可以考虑向法院提起诉讼，要求原法人履行配合变更的义务。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明变更的合法性与必要性，以及原法人的不配合行为。
- 申请强制执行：如果法院判决支持您的变更请求，但原法人仍拒不履行，您可以向法院申请强制执行。法院将依法采取措施，强制原法人配合完成变更手续。
注意法律风险与合规性：
- 在整个过程中，务必确保所有操作都符合法律法规的要求，避免因违规操作而引发新的法律风险。例如，确保变更申请材料的真实性和完整性，遵守烟草专卖局的相关规定和程序等。
考虑实际操作的便捷性：
- 如果原法人确实无法联系或拒不配合，且变更手续紧迫，您可以考虑咨询烟草专卖局是否可以通过其他方式（如公告送达等）完成变更手续。不过，这种方式的具体适用性和操作流程可能因地区而异，需要具体咨询当地烟草专卖局。
可能面临的法律后果与风险提示：
- 如果未经合法程序擅自变更烟草证法人，可能面临烟草专卖局的处罚，包括但不限于罚款、吊销许可证等。
- 在诉讼过程中，如果无法提供充分的证据证明变更的合法性与必要性，或者原法人提出有效的抗辩理由，可能导致诉讼失败，无法实现变更目的。
建议与总结：
- 在处理此类问题时，建议保持冷静和理性，遵循法律法规的要求和程序进行操作。
- 尽可能通过协商和沟通解决问题，以减少法律风险和成本。
- 如果协商无果，及时寻求行政协助或法律途径解决问题，确保变更手续的合法性和有效性。
如有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。