军官因醉驾被判处在军事监狱服刑的，将面临军事司法体系下的刑罚执行及相关纪律处分，具体处理方式如下：

1. 军事司法程序与刑罚执行
   军官醉驾若构成危险驾驶罪（依据《刑法》第133条之一），将由军事法院审理并判决。若被判处拘役或有期徒刑，需在军事监狱服刑。军事监狱的管理严格遵循《监狱法》及军队内部规定，服刑期间军官的军籍可能被保留，但需接受军事化改造，包括队列训练、思想教育等，且晋升、评优等权利将受限。

2. 军队内部纪律处分
   根据《中国人民解放军纪律条令》，醉驾属于严重违纪行为，除刑事处罚外，军官还可能面临：

   • 行政处分：如警告、严重警告、记过、记大过、降职（级）、撤职、开除军籍等。
     
   • 职务调整：可能被暂停职务、调离原岗位，甚至强制退役。
     
   • 经济处罚：如扣减工资、津贴或奖金。
     

3. 对职业生涯的长期影响

   • 军籍保留与退役：若刑期较短（如拘役），服刑后可能保留军籍但职务受限；若刑期较长或情节严重（如造成重大事故），可能被开除军籍并强制退役。
     
   • 退役后影响：即使退役，刑事犯罪记录可能影响其后续就业（如公务员、事业单位招考）及社会信用评价。
     

4. 特殊情形处理

   • 战时或执行任务期间醉驾：可能从重处罚，甚至构成更严重罪名（如危害军事安全罪）。
     
   • 自首或立功表现：若军官在案发后主动投案或协助破案，可能依法从轻或减轻处罚，但纪律处分仍难避免。
     

建议：若涉及具体案件，需结合犯罪情节（如血液酒精含量、是否造成事故等）、军官军衔及部队管理规定综合判断。如有进一步疑问，可直接向我咨询军事法律相关问题。