结论：本金起诉后利息又单独起诉的诉讼时效问题，需根据具体情况判断。在一般情况下，利息债权与本金债权适用统一诉讼时效；但在特殊情况下，如定期给付利息或当事人特别约定时，利息可单独适用诉讼时效。以下是对该问题的详细分析：
一、利息与诉讼时效的一般关系
法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。利息作为债权的一部分，同样受到这一诉讼时效的限制。
利息债权的从属性：在多数情形下，利息之债视为本金之债的从债，具有从属性。因此，利息债权通常与本金债权密切相关，并适用统一的诉讼时效期间。若本金债权超过诉讼时效，利息债权亦可能受影响。
二、利息诉讼时效的计算及特殊情况
起算时间：利息诉讼时效的起算时间一般从权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算，即债务人未按约定时间支付利息时，三年的诉讼时效期间开始计算。
定期给付利息：在定期给付利息的情况下，每一期利息债权具有相对独立性，单独适用诉讼时效。每期利息的产生和计算有明确的时间节点和金额，与其他期次利息相互区分。因此，如果债权人在某一期利息的诉讼时效期间内未主张权利，之后仅就该期利息提起诉讼，而该期利息的诉讼时效尚未届满，则法院可能会支持债权人的请求。
特别约定：若当事人在合同中明确约定利息债权的诉讼时效单独计算，且不违反法律、行政法规强制性规定，则该约定有效，利息将单独适用诉讼时效。
最长保护期：需注意，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，但特殊情况除外。这一规定同样适用于利息债权。
三、利息与本金诉讼时效的关系及独立性
分开计算的情况：在某些情况下，利息的诉讼时效可与本金的诉讼时效分开计算。例如，有具体约定给付期限的利息，其诉讼时效从约定支付期限届满之日起计算，不受本金诉讼时效影响。此外，即使本金已偿还，债权人仍可就未支付的利息单独提起诉讼，因利息和本金是两个独立的诉讼标的。
共同计算的情况：在大多数情况下，利息作为债权的一部分，跟随主债权一起计算诉讼时效。当主债权适用诉讼时效时，其附带的利息也应当随之适用。如果债权人在诉讼时效期间内没有向债务人主张债权（包括本金和利息），那么一旦诉讼时效届满，债务人就可以获得诉讼时效抗辩权，拒绝履行还款义务，包括本金和相应的利息。
四、实际操作建议
及时主张权利：债权人在维护自己的权益时，应当及时在诉讼时效期间内向债务人主张债权及其利息，以避免因超过诉讼时效而丧失胜诉权。
明确合同约定：在签订借款合同时，应明确约定利息的支付时间和方式，以及诉讼时效的计算方式（如是否单独计算等），以便在发生纠纷时能够有据可依。
咨询专业律师：如遇复杂情况或争议，建议直接向我咨询以获取准确的法律意见和帮助。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供针对性的法律建议。
综上所述，本金起诉后利息又单独起诉的诉讼时效问题需根据具体情况判断。债权人在主张利息权利时，应密切关注诉讼时效的相关规定，并采取相应的措施以确保在法定期间内行使权利。