土地转让协议书上写转让金一次性付清但没写金额，该条款的效力存在不确定性，需分情况讨论：

1. 协议整体效力可能不受影响，但该条款可能因不明确而无法执行
   根据《民法典》第143条，合同生效需满足“意思表示真实、不违法违规、具备明确条款”等条件。若协议其他部分（如土地位置、面积、双方身份等）合法有效，仅转让金金额缺失，协议整体可能仍有效，但“一次性付清”的条款因缺乏核心要素（金额）可能被认定为“约定不明”。
   根据《民法典》第510条，若双方能通过协商补充金额，或根据交易习惯、市场价格等推断合理金额，该条款可补正后执行；若无法达成一致，则可能因“无法履行”被撤销或认定无效。

2. 若金额是协议核心条款，未填写可能导致协议部分无效或可撤销
   土地转让协议中，转让金是核心条款之一。若金额缺失导致双方权利义务严重不对等（例如一方主张极低金额，另一方主张极高金额），可能触发《民法典》第154条“恶意串通损害他人利益”或第151条“显失公平”的情形，受损害方有权请求法院撤销该条款或认定协议部分无效。

3. 实务建议：立即补充金额或签订补充协议
   为避免纠纷，双方应尽快通过书面形式明确转让金金额，并注明“此金额为原协议中‘一次性付清’条款的补充，与原协议具有同等效力”。若已产生争议，可收集以下证据辅助主张：

   • 同期同类土地转让的市场价格；
     
   • 双方此前沟通中提及的金额记录（如微信、邮件）；
     
   • 第三方评估报告或中介机构报价。

总结：金额缺失不直接导致协议无效，但会引发执行风险。建议优先协商补充，若无法达成一致，需结合具体证据和交易背景判断条款效力。如有进一步疑问，可直接向我咨询土地转让相关法律问题。