债务人还清债权人债务后，法院会根据不同情况作出相应处理，具体如下：

1. 若案件处于执行阶段：

   • 当债务人完全履行了法院判决或调解书所确定的还款义务后，债权人应当向法院提交结案申请，说明债务人已履行完毕。
   • 法院在核实债务人确实已还清债务后，会作出执行结案的裁定，并通知双方当事人。此时，执行程序终结，法院会解除对债务人财产的查封、冻结等强制执行措施（如有），并恢复债务人的正常财产权益。

2. 若案件处于诉讼阶段且已判决但未进入执行：

   • 在诉讼过程中，如果债务人在判决前或判决后、执行前主动还清了债务，债权人可以向法院申请撤诉或者告知法院债务已清偿的情况。
   • 法院在确认债务清偿事实后，会裁定准许撤诉（如果债权人申请撤诉）或者作出相应的结案处理，诉讼程序因此终结。

3. 若案件涉及保全措施：

   • 在诉讼或执行过程中，如果法院对债务人的财产采取了保全措施（如查封、扣押、冻结等），在债务人还清债务后，债权人应当及时向法院申请解除保全措施。
   • 法院在核实债务清偿情况后，会及时作出解除保全的裁定，并通知相关部门执行，以恢复债务人对相关财产的正常使用和处分权。

额外提醒：

• 债务人还清债务后，建议保留好还款凭证（如转账记录、收据等），以备不时之需。
• 如果债权人拒绝确认债务已清偿或拒绝配合法院结案，债务人可以向法院提供还款凭证等证据，申请法院确认债务清偿事实并作出相应处理。
• 在整个过程中，如果双方有任何争议或疑问，都可以及时向法院咨询或寻求法律帮助。

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