结论概述：根据2026年10号公告，农产品1%加计抵扣政策已取消，企业无权再按原政策进行税务申报。现行有效的抵扣方式主要包括两类凭证：农业生产者的自产销售发票（按9%计算抵扣）和小规模纳税人开具的3%专票（同样按9%计算抵扣）。以下结合新闻背景，从政策变化、现行抵扣方式、注意事项三个维度进行详细分析。

1. 政策变化分析

• 核心变化：财税2019年39号公告曾允许购进用于生产13%税率货物的农产品，在领用环节加计抵扣1%。但2026年10号公告已删除该条款，并明确未保留的国内增值税优惠政策均停止执行。因此，农产品加计1%的政策已正式取消。
• 法律后果：若企业仍按原政策进行税务申报，将面临税务风险，包括但不限于补缴税款、滞纳金及罚款等。

2. 现行有效的抵扣方式

• 农业生产者的自产销售发票：

  • 条件：企业必须直接向农业生产者购买其自产农产品。
  • 凭证要求：发票需注明“自产农产品销售”字样。
  • 不适用情况：从非生产者（如二道贩子）取得的发票不得计算抵扣；批发零售环节的蔬菜、部分鲜活肉蛋免税发票（属流通环节免税）也不得抵扣。

• 从小规模纳税人取得的3%专票：

  • 政策依据：财税2017年37号文规定的“低征高扣”政策仍有效。
  • 关键要求：上游小规模纳税人须放弃免税或减税，开具3%征收率的专用发票。若只开具1%发票，则下游企业无法按9%进行抵扣。

3. 注意事项

• 发票链条管理：企业应确保发票链条的完整性和合规性。若通过二道贩子采购农产品，应要求贩子自行向农户取得农产品销售发票或开具收购发票（按9%抵扣），再向购买方开具9%发票进行抵扣。
• 风险提示：农产品交易是虚开发票的重点监管领域，税务管控极为严格。企业务必确保业务真实、发票合规，以避免不必要的税务风险。

4. 热点事件延伸思考

• 法律后续影响：农产品加计抵扣政策的取消，将直接影响企业的税务筹划和成本控制。企业需及时调整税务策略，以适应新的政策环境。
• 对相关行业的警示意义：该事件提醒企业，在享受税收优惠政策时，应密切关注政策动态，及时调整经营策略，以避免因政策变化而带来的税务风险。
• 类似情况的预防措施：企业应建立健全的税务风险防控机制，加强与税务机关的沟通与协调，确保税务申报的准确性和合规性。

总结与建议：农产品1%加计抵扣政策已取消，企业应严格按照现行有效的抵扣方式进行税务申报。同时，企业应加强税务风险管理，确保业务真实、发票合规，以避免不必要的税务风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。