结论：在项目部盖章款项打入个人帐户，合同期满后个人又补签借条的情况下，是否可以追究公司责任，需根据具体情况分析，主要取决于款项性质、公司授权及补签借条的法律效力等因素。以下从不同角度进行详细分析：

一、款项性质与用途

1. 项目部款项性质：

   • 若项目部款项系公司为特定项目而拨付，且明确约定了款项用途，那么个人擅自将款项打入个人账户可能构成违约或违法行为。
   • 在此情况下，即使个人补签了借条，也不能改变款项原本的性质和用途，公司仍有权要求个人返还款项，并可能追究其法律责任。

2. 个人借款性质：

   • 若个人补签的借条明确表明该款项为个人借款，且与公司项目无关，那么该借款行为应视为个人行为，与公司无关。
   • 在此情况下，公司通常不承担还款责任，除非有证据表明公司对个人借款行为存在过错或进行了授权。

二、公司授权与表见代理

1. 公司授权：

   • 若个人在将款项打入个人账户时，得到了公司的明确授权或同意，那么该行为可能被视为公司行为，公司需承担相应责任。
   • 但在此情况下，个人补签借条的行为可能构成对公司授权的滥用或超越，公司仍可根据具体情况追究个人责任。

2. 表见代理：

   • 若个人在行为时，使相对方（如借款人）有理由相信其有权代表公司进行交易，且相对方在交易时是善意的、无过失的，那么该行为可能构成表见代理。
   • 在表见代理的情况下，公司需承担代理行为的法律后果，但公司承担责任后，有权向个人追偿。

三、补签借条的法律效力

1. 借条内容：

   • 补签的借条应明确借款金额、借款期限、利息等关键条款，且内容应合法、有效。
   • 若借条内容存在瑕疵或违法之处，可能影响其法律效力，进而影响对公司责任的追究。

2. 借条签订时间：

   • 借条的签订时间应在合同期满后，且应明确表明是对之前款项的确认或重新约定。
   • 若借条签订时间存在争议或不明确，可能影响对公司责任的认定。

四、法律建议

1. 收集证据：

   • 无论是公司还是个人，都应积极收集相关证据，如合同、授权书、转账记录、借条等，以证明自己的主张。

2. 咨询专业律师：

   • 在此类复杂情况下，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。作为专业律师，我可以根据具体情况为你提供详细的法律分析和建议。

3. 协商或诉讼：

   • 根据证据和法律规定，双方可以尝试通过协商解决争议；若协商无果，则可以通过诉讼途径解决。

总结：在项目部盖章款项打入个人帐户，合同期满后个人又补签借条的情况下，是否可以追究公司责任需根据具体情况分析。建议双方积极收集证据，咨询专业律师，并根据法律规定和证据情况选择合适的解决方式。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。