结论：检察院查封已外嫁女儿的房产是否合法，需根据房产的来源、性质以及是否与父亲违法犯罪所得有关等因素综合判断。若房产与父亲违法犯罪所得无关，则查封行为可能不合法；若有关，则可能合法。以下为详细分析：
一、房产来源与性质是关键
个人财产：如果已外嫁女儿的房产是其个人财产，例如通过继承、赠与（非来自父亲）、个人劳动所得等方式取得，且与父亲的违法犯罪行为无关，那么检察院查封该房产的行为可能缺乏法律依据，是不合法的。因为根据法律规定，个人财产受法律保护，非因法定事由和法定程序不得被查封、扣押或冻结。
家庭共有财产或涉及父亲违法所得：如果房产属于家庭共有财产，且其中部分或全部与父亲的违法犯罪所得有关，或者房产本身是父亲违法犯罪所得的一部分，那么检察院在侦查过程中，为了追缴违法所得或保障诉讼顺利进行，有权对该房产进行查封。这种情况下，查封行为是合法的。
二、法律程序与权利保障
法律程序：检察院在查封房产时，必须遵循严格的法律程序，包括出具查封决定书、通知被查封人、告知查封理由和依据等。如果检察院未遵循这些程序，或者查封行为超出了法律规定的范围，那么被查封人有权提出异议，并可以通过法律途径维护自己的合法权益。
权利保障：即使房产被查封，被查封人仍然享有基本的居住权等合法权益。如果查封行为给被查封人造成了不必要的损失或困扰，被查封人也有权要求检察院承担相应的赔偿责任。
三、建议与行动
了解具体情况：首先，你需要了解房产的具体来源、性质以及是否与父亲的违法犯罪行为有关。这有助于你判断检察院的查封行为是否合法。
咨询专业律师：如果你对检察院的查封行为有异议，或者不确定自己的权益是否受到侵害，建议咨询专业律师。律师可以根据你的具体情况，为你提供专业的法律意见和帮助。
维护合法权益：如果确认检察院的查封行为不合法，或者查封行为给你造成了不必要的损失，你可以通过法律途径维护自己的合法权益。这包括提出异议、申请复议、提起诉讼等。
最后，我想强调的是，法律问题往往复杂多变，每个案件都有其独特的事实和法律背景。因此，在处理类似问题时，建议你保持冷静、理性，并寻求专业律师的帮助。如果你有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。