在职员工申请劳动仲裁是维护自身合法权益的重要途径，以下是一个详细且深入的指南，帮助您了解整个流程：
一、确认仲裁受理范围和时效
首先，您需要确认您的争议是否属于劳动仲裁的受理范围。劳动仲裁主要受理以下类型的争议：
同时，您需要注意仲裁时效。劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，自您知道或应当知道权利被侵害之日起计算。若因拖欠劳动报酬发生争议，且劳动关系仍在存续期间，则不受一年时效限制；但劳动关系终止后，应自终止之日起一年内提出。
二、准备仲裁申请材料
接下来，您需要准备以下仲裁申请材料：
仲裁申请书：详细载明您和用人单位的基本信息（如姓名、性别、年龄、职业、工作单位、住所及法定代表人信息等），明确仲裁请求、事实和理由，并提供证据清单及证人信息。申请书需提交正本一份，并按被申请人人数提供副本。
身份证明：提供您的身份证原件及复印件，以及用人单位的工商登记信息（如营业执照复印件或工商注册信息查询单）。
证据材料：收集并准备证明劳动关系存在的证据（如劳动合同、工资支付记录、社保缴纳记录、工作证、考勤记录等）及与争议事项相关的其他证据（如加班申请单、聊天记录、邮件往来等）。证据材料需准备多份，数量与申请书副本相同。
三、确定仲裁管辖
劳动争议由劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会管辖。若双方当事人分别向两地仲裁委员会申请仲裁，则由劳动合同履行地的仲裁委员会管辖。因此，您需要确定哪个仲裁委员会对您的案件有管辖权。
四、提交仲裁申请
将准备好的仲裁申请书和证据材料一并提交给有管辖权的劳动争议仲裁委员会。您可以选择现场提交或邮寄方式（建议使用挂号信或快递，并保留投递凭证）。委员会将在五日内决定是否受理，并通知您。
五、参与仲裁程序
案件排期与送达：仲裁委员会受理后，会安排开庭时间，并提前通知您和用人单位。同时，将仲裁申请书副本送达用人单位，要求其在十日内提交答辩书。
开庭审理：您需要按时参加庭审，进行举证、质证和辩论。在庭审中，您应陈述仲裁请求、事实和理由，提供证据并进行质证。若您无法亲自参加，需提前请假并委托代理人。
调解与裁决：仲裁委员会可能组织调解。若调解成功，制作调解书；若调解不成，根据庭审情况和证据作出裁决，并制作仲裁裁决书。裁决书一般会在十五日内送达双方当事人。
六、执行仲裁结果或提起诉讼
执行仲裁结果：若用人单位自觉履行裁决义务，争议解决。若不履行，您可在两年内向人民法院申请强制执行。
提起诉讼：若您对裁决结果不满，可以向人民法院提起诉讼。诉讼程序需遵循相关法律规定，并注意诉讼时效。
七、注意事项
希望这个指南能帮助您了解在职申请劳动仲裁的整个流程。如果您在申请过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时咨询专业的法律人士或劳动争议仲裁委员会的工作人员。