结论：停职调查期间工资是否发放，需根据停职的具体原因、用人单位的规章制度以及相关劳动法律法规来综合判断。一般情况下，若非员工过错导致停职，应支付工资；若因员工自身过错导致停职，则可能停发工资或按一定标准支付。

一、非员工过错导致的停职

1. 公司经营调整等原因

   • 处理原则：若停职是由于公司经营调整、停工停产等非员工过错原因导致，且停职时间不超过一个工资支付周期（通常为一个月），用人单位应按照劳动合同约定的标准支付全额工资。
   • 超过一个工资支付周期：若停职时间超过一个工资支付周期，且员工提供了正常劳动，用人单位支付的工资不得低于当地最低工资标准；若员工未提供正常劳动，用人单位应按照不低于当地最低工资标准的一定比例（各地规定有所不同，一般在70%-80%左右）支付生活费。

2. 公司调查等原因

   • 未认定员工过错：在停职调查期间，若未最终认定员工有过错，通常应正常发放工资。这是因为劳动关系仍然存续，员工享有工资待遇的基本权利。

二、员工自身过错导致的停职

1. 严重违反规章制度

   • 处理原则：若员工严重违反用人单位的规章制度，如多次旷工、违反竞业限制约定等，且用人单位的规章制度符合法律规定、制定程序合法并已向员工公示告知，则在停职期间，用人单位可以不支付工资。但需注意，若最终调查证明员工无过错，应补发停职期间的全部工资。
   • 赔偿与工资扣除：若员工行为给公司造成损失，用人单位可要求其赔偿，赔偿额可从工资中扣除，但每月扣除部分不得超过工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。

2. 涉嫌违法犯罪

   • 暂时停止劳动合同履行：当员工因涉嫌违法犯罪被采取限制人身自由措施时，用人单位可以暂时停止劳动合同的履行，不支付工资。
   • 补发工资：若最终认定员工无罪或不构成应受处罚的情形，恢复履行劳动合同后，用人单位应补发停职期间的工资。

三、其他特殊情况

1. 员工主动申请停职

   • 工资停发：若员工主动申请停职，工资将会全部被停发，因为员工是自愿放弃工作机会和相应的劳动报酬。

2. 公司内部规定与劳动合同

   • 内部规定：若公司有明确的关于停职期间工资待遇的内部规定，且不违反国家强制性法律规定，则应按照这些规定执行。
   • 劳动合同：若内部规定不明确或没有相关规定，应参考劳动合同中的相关条款来执行。劳动合同中通常会明确约定员工的工资待遇、支付方式及时间等内容。

四、法律依据与建议

• 法律依据：停职期间工资发放的具体规定需遵循《中华人民共和国劳动合同法》、《中华人民共和国劳动法》以及《工资支付暂行规定》等相关法律法规。这些法律法规保障了员工的合法权益，包括在停职期间的工资待遇。
• 建议：在处理停职期间工资问题时，用人单位应明确停职的原因，并依据相关法律法规和单位规章制度来决定是否支付工资及支付标准。同时，建议用人单位在制定规章制度时，充分考虑员工的权益保障，确保规章制度的合法性和合理性。员工在面临停职情况时，也应了解自己的权益和义务，如有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。

综上所述，停职调查期间工资是否发放需综合考虑多种因素，包括停职原因、用人单位规章制度、劳动合同约定以及相关法律法规等。用人单位应依法行事，确保员工的基本权益不受损害；员工也应了解自己的权益并采取合法途径维护自身权益。