结论：乙方施工未与甲方签订协议，这种情况确实存在法律风险，但并非无法补救或处理。以下是从不同角度给出的分析和建议。
一、法律风险分析
合同缺失的风险：
- 在建设工程领域，合同是明确双方权利义务、保障工程顺利进行的重要法律文件。未签订合同，一旦发生纠纷，双方可能难以明确各自的责任和权益，导致维权困难。
- 缺乏合同约束，乙方可能面临甲方拖欠工程款、变更工程要求等风险，而甲方则可能面临工程质量不达标、工期延误等风险。
证据收集的挑战：
- 在没有合同的情况下，乙方需要依靠其他证据来证明自己的施工行为、工程量、工程质量等，这往往比有合同的情况下更为困难。
- 证据的收集可能涉及施工过程中的各种文件、记录、照片、视频等，需要乙方在施工过程中就注意保留和整理。
二、补救措施与建议
尽快补签合同：
- 如果双方仍有合作意愿，应尽快补签建设工程合同，明确双方的权利义务、工程范围、工期、质量标准、付款方式等关键条款。
- 补签合同时，应确保合同内容合法、合规，避免使用模糊或歧义的条款。
收集并保留证据：
- 在补签合同之前或无法补签合同的情况下，乙方应尽可能收集并保留与施工相关的所有证据，包括施工图纸、施工记录、验收报告、付款凭证等。
- 这些证据将在未来可能发生的纠纷中起到关键作用，有助于证明乙方的施工行为、工程量、工程质量等。
协商与调解：
- 在发生纠纷时，双方应首先尝试通过协商或调解的方式解决争议。这可以节省时间和成本，避免诉讼带来的不确定性和风险。
- 协商或调解时，双方应保持冷静和理性，尊重对方的权益和诉求，寻求互利共赢的解决方案。
法律途径维权：
- 如果协商或调解无法达成一致，乙方可以考虑通过法律途径维权。这包括向法院提起诉讼或申请仲裁等。
- 在提起诉讼或申请仲裁前，乙方应充分准备证据材料，明确自己的诉讼请求和事实依据。同时，也应了解相关法律程序和规定，确保自己的维权行为合法有效。
三、特殊情况处理
如果甲方拒绝补签合同或支付工程款：
- 乙方可以依据《民法典》中关于建设工程合同的规定，向法院提起诉讼或申请仲裁，要求甲方支付工程款及可能产生的违约金、利息等。
- 在诉讼或仲裁过程中，乙方需要提供充分的证据证明自己的施工行为和工程量等事实。
如果工程质量存在问题：
- 无论是否签订合同，乙方都应对工程质量负责。如果工程质量存在问题，乙方应承担修复、返工等责任。
- 如果因工程质量问题给甲方造成损失的，乙方还应承担赔偿责任。
四、预防措施
加强合同管理：
- 在未来的合作中，乙方应加强合同管理，确保在施工前与甲方签订合法有效的建设工程合同。
- 合同应明确双方的权利义务、工程范围、工期、质量标准、付款方式等关键条款，避免使用模糊或歧义的条款。
完善证据收集机制：
- 乙方应建立完善的证据收集机制，在施工过程中及时收集并保留与施工相关的所有证据。
- 这有助于在未来可能发生的纠纷中证明自己的施工行为、工程量、工程质量等事实。
作为曾新律师，我建议乙方在施工前务必与甲方签订合法有效的建设工程合同，并在施工过程中注意收集和保留相关证据。如果已经发生未签订合同的情况，应尽快采取补救措施并咨询专业律师的意见。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。