核心结论：一个易制毒购买合同能否分两次申请运输证，需根据具体情形判断，通常需满足一定条件且符合法规要求才可行。以下分情况详细说明：

1. 法规层面的一般要求 根据《易制毒化学品管理条例》及配套规定，运输易制毒化学品需依法申请运输许可证或进行备案证明。对于同一购买合同项下的货物运输，原则上应一次性申请运输证，确保运输行为与合同内容、审批事项严格对应，便于监管部门掌握货物流向，防止易制毒化学品流入非法渠道。

2. 可分两次申请的例外情形 若因客观原因（如运输工具载重限制、运输路线安全要求、不可抗力因素等）导致无法一次性运输完毕，且符合以下条件时，可能允许分两次申请运输证：

   • 合同分割合理性：购买合同需明确约定分批运输的条款，或双方另行签订补充协议，明确每批运输的数量、时间、路线等关键信息，确保分批运输具有合法依据。
   • 审批部门认可：需向原审批部门（如公安机关）提交书面申请，说明分批运输的必要性、具体安排及安全保障措施，并附上合同、补充协议等相关证明材料。经审批部门审核同意后，方可分两次申请运输证。
   • 运输证内容匹配：每次申请的运输证需与实际运输的货物数量、品种、路线等信息完全一致，且两次运输证的累计数量不得超过合同总量。

3. 操作建议与风险提示

   • 提前规划：在签订购买合同时，应充分考虑运输能力、路线安全等因素，尽量避免分批运输。若确需分批，应在合同中明确约定，并提前与审批部门沟通。
   • 严格合规：分批运输时，务必确保每次运输均符合法规要求，包括运输证申请、货物包装、标识、随车携带证明文件等环节，避免因违规操作导致行政处罚或刑事责任。
   • 保留证据：妥善保存合同、补充协议、审批文件、运输记录等证据材料，以备监管部门查验。

总结：一个易制毒购买合同能否分两次申请运输证，需结合合同约定、客观原因及审批部门意见综合判断。若您有具体操作需求或遇到相关问题，可直接向我咨询，我将结合实际情况为您提供详细解答。