结论：事业单位职工在取保候审二年期间每月只发100元工资，这一做法通常是不合适的，但具体是否合法需结合实际情况判断。以下从多个角度进行分析：

一、法律对取保候审期间工资支付的规定

1. 基本原则：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，劳动者在取保候审期间，若未被解除劳动合同，用人单位应继续履行劳动合同，包括支付工资。
   • 取保候审本身并不构成解除劳动合同的法定理由，因此，用人单位不得仅因职工被取保候审就降低或停发其工资。

2. 工资支付标准：

   • 工资支付应遵循劳动合同的约定以及国家规定的最低工资标准。若劳动合同中未明确约定取保候审期间的工资支付标准，则应参照国家相关规定执行。
   • 每月只发100元工资，显然远低于一般地区的最低工资标准，因此，这一做法在大多数情况下是不合法的。

二、取保候审对工资支付的可能影响

1. 工作性质与工资关系：

   • 若职工在取保候审期间无法正常工作，且其工作性质决定了工资与工作成果直接相关（如计件工资），则用人单位可能根据实际情况调整工资支付。
   • 但即便如此，调整后的工资也不应低于最低工资标准，且应确保职工的基本生活需求。

2. 单位规章制度与劳动合同：

   • 若单位规章制度或劳动合同中明确规定了取保候审期间的工资支付标准，且该标准不低于最低工资标准，则用人单位可以按照该标准支付工资。
   • 但若规章制度或劳动合同中的相关规定违反了法律法规的强制性规定，则这些规定是无效的，用人单位仍需按照法律法规的规定支付工资。

三、职工的权利与救济途径

1. 权利：

   • 职工有权要求用人单位按照劳动合同的约定和国家规定支付工资。
   • 若用人单位拒绝支付或支付不足，职工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

2. 救济途径：

   • 职工可以先与用人单位协商解决工资支付问题。
   • 若协商无果，职工可以向当地劳动监察部门投诉，要求劳动监察部门介入调查并责令用人单位改正。
   • 职工还可以直接向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求用人单位支付拖欠的工资及可能的赔偿金。

四、特殊情况下的考虑

1. 刑事案件进展：

   • 若职工最终被法院判决有罪并受到刑事处罚，用人单位可能根据相关规定解除劳动合同。但在解除劳动合同前，用人单位仍需按照法律法规的规定支付工资。

2. 单位经济状况：

   • 即便单位经济状况不佳，也不能成为降低或停发职工工资的理由。单位应通过合法途径解决经济问题，如申请破产、重组等，而不是将经济压力转嫁给职工。

建议：若您作为事业单位职工在取保候审期间遇到工资支付问题，建议首先与用人单位协商解决。若协商无果，您可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以维护自己的合法权益。同时，您也可以咨询我，获取更具体的法律建议和帮助。