交警在店门口查车是否合法需分情况讨论，具体处理方式需结合现场情况判断，以下是详细分析：

一、合法性判断依据

1. 执法权限范围
   根据《道路交通安全法》第五条，交警的执法区域为”道路”，包括公路、城市道路及虽在单位管辖范围但允许社会机动车通行的地方（如广场、公共停车场等）。若店门口属于公共道路或允许社会车辆通行的区域，交警有权在此执法；若属于完全封闭的私人场地（如仅限内部车辆出入的停车场），则超出其执法范围。

2. 执法程序要求
   即使店门口属于合法执法区域，交警仍需遵守以下程序：

   • 出示执法证件（《人民警察法》第二十三条）；
     
   • 现场设置警示标志（《道路交通安全违法行为处理程序规定》第七条）；
     
   • 对查扣车辆开具法律文书（《行政强制法》第十八条）。
     若未履行上述程序，可能构成程序违法。

二、常见合法场景

1. 店门口连接公共道路
   例如：商铺位于开放式商业街，店门口与市政道路无物理隔离，车辆可自由通行。此时交警有权在此检查驾驶证、行驶证、是否酒驾等。

2. 针对特定违法行为的专项整治
   例如：交警在餐饮集中区开展酒驾夜查行动，即使店门口属于半开放区域，只要车辆可驶入公共道路，执法行为通常合法。

三、可能存在的违法情形

1. 越权执法
   若店门口为完全封闭的私人场地（如企业内部停车场），且无社会车辆通行，交警无权在此查车。此时可要求其出示执法依据，或向公安机关督察部门投诉。

2. 程序违法
   例如：未出示证件、未说明执法理由、强行拖车未开具凭证等。此时可通过行政复议或行政诉讼主张权利。

四、处理建议

1. 现场应对

   • 保持冷静，要求交警出示证件并说明执法依据；
     
   • 若对执法合法性存疑，可拍摄现场照片/视频（注意避免干扰执法）；
     
   • 拒绝签署任何未明确说明内容的法律文书。

2. 事后救济

   • 若认为执法违法，可向当地公安局督察部门（12389）或上级交管部门投诉；
     
   • 若因违法执法导致损失（如车辆被错误扣押），可提起行政诉讼要求赔偿。

提示：若您遇到具体执法争议，建议提供以下信息以便进一步分析：

1. 店门口是否与公共道路相连？
   
2. 交警是否出示证件并说明理由？
   
3. 现场是否设置警示标志？
   您可直接描述细节，我将结合具体情形为您制定应对方案。