当您遇到公证书被不动产相关部门收走的情况时，这确实是一个需要细致处理的问题。以下是一套详尽的应对策略，希望能帮助您妥善解决此事：
一、首先明确公证书被收走的原因
及时与相关部门沟通：您需要立即与收回公证书的不动产部门（如不动产登记中心、房管局等）取得联系。可以通过电话、邮件或亲自前往的方式，明确询问他们收走公证书的具体原因和依据。
要求提供书面说明：在沟通的过程中，务必要求相关部门提供书面的政策文件、法律依据或处理决定等材料。这有助于您更准确地了解情况，并为后续的应对措施提供依据。
二、根据收回原因采取针对性措施
若因政策调整或政府行为收回：
- 仔细阅读并理解相关政策文件，特别是关于不动产管理、改革或相关调整的内容。
- 与政府部门协商，了解是否有补偿措施或替代方案，确保您的权益得到合理保障。例如，如果是因为城市规划调整导致的不动产变动，可能涉及搬迁补偿或新的不动产安排。
若因违规使用或存在纠纷收回：
- 核实是否存在被指控的违规行为，如擅自改动不动产结构、违反使用规定等。
- 如果您认为自己没有违规或存在误解，应向相关部门提出申诉，并提供相关证据证明自己的使用行为符合规定。
- 如果涉及产权纠纷，详细了解纠纷的具体情况，尝试与纠纷相关方进行协商，寻求一致解决方案。必要时，可寻求居委会、街道办事处或法律专业人士的调解。
若因公证书本身存在问题收回：
- 检查公证书是否存在错误、遗漏或不符合规定的情况。
- 如果公证书确实存在问题，您可能需要联系原公证机构进行更正或重新办理。
三、准备充分的证据材料
- 收集与不动产相关的所有文件，包括购房合同、付款凭证、历史公证书、居住或使用证明等。
- 准备能够证明您对不动产享有合法权益的证据，如居住记录、维修记录、缴费凭证等。
四、寻求法律咨询与救济
- 在应对过程中，及时咨询专业律师，了解自己的合法权益和可能的法律救济途径。
- 如果认为公证书被收走存在错误或不当，应按照法定程序向相关部门提出异议或申诉，并提交相关证据和材料。
- 如果无法通过协商解决问题，可根据律师的建议选择合适的法律救济途径，如向法院提起诉讼或申请行政复议。
五、保持沟通与合作
- 与不动产相关部门保持积极沟通，及时了解处理进展和结果。
- 配合相关部门的调查和处理工作，提供必要的协助和信息。同时，注意保留与相关部门沟通的记录，以备后续需要。
总之，面对公证书被不动产部门收走的情况，您应保持冷静并尽快采取行动。通过明确原因、采取针对性措施、准备充分证据、咨询律师以及保持沟通与合作等途径来维护自己的合法权益。希望这些建议能对您有所帮助。